 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 1 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1359 | 回復: 0 | |||
[交流]
AIDD生物分子表征、類藥性評價
|
|
文章來源：公眾號科研討論圈 1. 分子描述符和分子指紋 1.1 分子描述符和分子指紋概念 1.2 分子描述符類別和特點 1.3 分子指紋的類別和特點 2. 分子描述符/指紋計算軟件 2.1 分子表示方法和格式 2.1.1 SMILES，SMARTS，SDF, MOL, MOL2, PDB 2.1.2 JEM Editor, Chemdoodle, ChemAxon, ChemDraw, DrugBank 2.2 RDKit簡介及環(huán)境部署 2.3 RDKit中如何操作分子 2.4 RDKit中描述符的計算以及存儲 2.5 OpenBabel簡介及環(huán)境部署 2.6 OpenBabel操作分子和格式轉(zhuǎn)換 2.7 OpenBabel中的分子描述符和指紋 2.8 ChemDes計算分子描述符和 2.9 ChemDes計算分子指紋 2.10 ChemDes中的格式轉(zhuǎn)換 2.11 ChemDes中的分子優(yōu)化 2.12 PyBioMed 簡介環(huán)境部署 2.13 PyBioMed 獲取分子 2.14 PyBioMed 計算分子描述符 2.15 PyBioMed 計算分子指紋 2.16 PyBioMed 計算蛋白質(zhì)描述符 2.17PyBioMed 計算核酸描述符 2.18 PyBioMed 計算相互作用描述符 3. 結構預處理和數(shù)據(jù)預處理 3.1 PyBioMed結構預處理 3.2 ChemSAR結構預處理 3.3 KNIME 結構預處理 3.4 Excel數(shù)據(jù)預處理及注意的問題 3.5 KNIME數(shù)據(jù)預處理 3.6 Pandas環(huán)境配置以及基本操作 3.6 sklearn數(shù)據(jù)預處理 3.7 歸一化與空值處理 4. 算法簡單介紹和分類 4.1 藥物設計中人工智能常用算法簡介 4.2 常用算法實現(xiàn)軟件或工具介紹 5. KNIME軟件介紹 5.1 KNIME軟件特色和界面 5.2 KNIME軟件構建基本計算任務 5.3 KNIME軟件社區(qū)支持 5.4 KNIME軟件定制化插件 5.5 KNIME軟件第三方支持 6. 特征選擇 6.1 基于sklearn的特征選擇 6.1.1 相關性分析，相關性繪圖 6.1.2 單變量特征選擇及選擇K個特征 6.1.3 遞歸式特征刪除 6.2 基于KNIME流程的特征選擇 6.2.1 相關性分析，相關性繪圖 6.2.2 單變量特征選擇 6.2.3 遞歸式特征刪除 7. 模型的評價與解釋 7.1 回歸模型和分類模型的評價指標 7.2 應用域的評估 7.3 基于樹的模型的解釋 8. ADMET介紹 8.1 ADMET概念以及意義 8.2 基于人工智能的ADMET虛擬評價方法的進展 8.3 ADMET計算資源（ADMETlab、ADMETsar等） 9. KNIME軟件構建ADMET模型 9.1 KNIME軟件配置相關插件 9.2 caco-2細胞滲透性數(shù)據(jù)概覽 9.3 結構預處理 9.4 描述符和指紋計算 9.5 SVM模型構建以及參數(shù)調(diào)整 9.6 RF模型構架及參數(shù)調(diào)整 9.7 RNN模型構建以及簡單超參數(shù)調(diào)整 10. ADMET計算軟件和實操 10.1 ADMETlab（v1.0 與v2.0）計算平臺使用 10.2 admetSAR計算平臺使用 10.3 本地模型調(diào)用以及預測 11. 噪聲過濾和相似性搜索 11.1 FAFDrugs4過濾 11.2 指紋和相似性度量計算 11.3 Swiss-Similarity相似性搜索 12. 機器學習模型構建和預測 12.1 收集GRK2化合物（講解過程） 12.2 計算合適的分子表征 12.3 算法和特征選擇 12.4 模型構建和評價 12.5 應用模型篩選化合物庫 13. 分子對接 13.1 蛋白質(zhì)預處理 13.2 小分子預處理 13.3 可應用Swiss-Dock對接 14. ADMET評估 14.1 ADMETlab計算并評估 14.2 確定相關性質(zhì)的參考范圍 14.3 評估并確定Hits. |
回復此樓» 猜你喜歡
招調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
0703 東華大學 理學化學均過 a 線，總分 281 求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復
-
材料學碩318求調(diào)劑
已經(jīng)有21人回復
-
271求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
328求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
080500材料科學與工程
已經(jīng)有11人回復
-
成果系統(tǒng)訪問量大，請15分鐘后再嘗試。由此給您造成的不便，敬請諒解。
已經(jīng)有17人回復
-
282求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
化工282求調(diào)劑一志愿211
已經(jīng)有4人回復
» 本主題相關商家推薦: (我也要在這里推廣)
相關版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 pang04 的主題更新
| 1 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 招調(diào)劑 +5 | 帆船哥 2026-03-04 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 0856材料與化工求調(diào)劑！ +5 | 化工考生111 2026-03-04 | 9/450 |
|
|
[考研] 一志愿山東大學105500藥學專碩，總分302求調(diào)劑 +3 | 五維天空 2026-03-04 | 5/250 |
|
|
|
[考博] 申博 +3 | 添菜了哈 2026-03-04 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料類考研調(diào)劑 +7 | gemmgemm 2026-03-01 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 化學專業(yè)調(diào)劑 +3 | 好好好1233 2026-03-04 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 復試調(diào)劑 +3 | 呼呼？~+123456 2026-03-05 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +3 | 是樂渝哇 2026-03-04 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請] 沒有青基直接申請面上，感覺自己瘋了 +6 | kevin63t 2026-03-02 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工大學-085602-總分296分-求調(diào)劑 +7 | 紫川葡柚 2026-03-04 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 264求調(diào)劑 +3 | thext 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 主題 +3 | realstar2006 2026-02-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑一志愿中海洋 +3 | lour. 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 266材料化工求調(diào)劑 +3 | 哇塞王帥 2026-03-03 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0805總分292，求調(diào)劑 +12 | 幻想之殤 2026-03-01 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +6 | 天下熯 2026-03-02 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 化學0703求調(diào)劑 學碩 理/工科均可 總分279 +3 | 1一11 2026-03-03 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 【2026 碩士調(diào)劑】課題組 招收調(diào)劑生 +3 | 考研版棒棒 2026-03-02 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 化工專碩342，一志愿大連理工大學，求調(diào)劑 +6 | kyf化工 2026-02-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料學調(diào)劑 +10 | 提神豆沙包 2026-02-28 | 12/600 |
|