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Cell | 震撼發(fā)布！迄今為止規(guī)模最大的小鼠蛋白互作組
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文獻(xiàn)來源：Skinnider, Michael A., et al. "An atlas of protein-protein interactions across mouse tissues." Cell 184.15 (2021): 4073-4089. PMID: 34214469 作者：頭禿的小師弟 導(dǎo)語 親愛的小伙伴們，今天的文章是一篇來自Cell主刊的文章，主題是關(guān)于蛋白-蛋白互作的檢測，這也是一個經(jīng)久不衰的話題了�，F(xiàn)有方法的主要挑戰(zhàn)在于難以實(shí)現(xiàn)組織特異(tissue-specific)的大規(guī)模檢測。為此，本文改進(jìn)了先前發(fā)表的技術(shù)，實(shí)現(xiàn)了小鼠大規(guī)模蛋白互作的檢測。接下來廢話不多說，快來看看本文到底說了個啥 摘要 蛋白分子之間的動態(tài)物理互作(physical interactions) 是細(xì)胞執(zhí)行生物學(xué)功能的基本方式。通常人們可通過高通量技術(shù)（如酵母雙雜交、蛋白質(zhì)微陣列等）構(gòu)建蛋白-蛋白互作圖譜。然而，現(xiàn)有技術(shù)很難捕捉動態(tài)的互作過程。本文開發(fā)了一種基于穩(wěn)定同位素標(biāo)記法和蛋白相關(guān)性檢測的蛋白互作預(yù)測方法(protein correlation profiling with stable isotope labeling of mammals, PCP-SILAM)。通過該技術(shù)，本研究測定了小鼠7種組織中共125000對蛋白互作對。通過比對不同組織的互作網(wǎng)絡(luò)，作者發(fā)現(xiàn)互作蛋白間重連(rewiring)現(xiàn)象十分頻繁，并且疾病相關(guān)蛋白趨于更頻繁地發(fā)生重連。本研究所開發(fā)的技術(shù)可應(yīng)用于組織特異的蛋白互作組檢測，這使得從蛋白組大規(guī)模層面上研究器官組織對生理和病理刺激條件的響應(yīng)成為可能。 歡迎關(guān)注公眾號“大師兄的文獻(xiàn)筆記” 注：未經(jīng)許可禁止轉(zhuǎn)載！英文原文↓↓↓: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0092867421007042 |
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