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北京艾柏森鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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轉(zhuǎn)基因小鼠鑒定方法
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一、 從鼠尾中提取DNA 采用鼠尾基因組DNA提取試劑盒提取DNA,操作如下: 1. 剪取小鼠長(zhǎng)度為0.4-0.6cm的尾巴,放入滅菌后的離心管中,加入180μL Buffer GTT。震蕩混勻。 2. 加入20μL proteinase K,渦旋震蕩,徹底混勻。 3. 置于56℃水浴,直到組織溶液完全清澈,一般需消化6-8h,賦予過(guò)程中渦旋震蕩,使樣品均勻分離。 注意: 1) 如果賦予和渦旋震蕩后仍然有膠狀物質(zhì),必要時(shí)過(guò)夜消化再加入20μl proteinase K消化,不會(huì)影響后續(xù)操作。 2) 如需去除RNA,可在上述步驟完成后,加入4μl濃度為100mg/μl的RNase A溶液,震蕩混勻,室溫放置5-10min。 4. 14000rpm 離心 1min,以消除未消化的類似于鼠毛等組織,將上清轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的滅過(guò)菌的離心管中。 5. 加入200μl Buffer GL,渦旋震蕩,充分混勻,加入200μl 無(wú)水乙醇,渦旋振 蕩,充分混勻,短暫離心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意: 1)加入Buffer GL 和無(wú)水乙醇后要立即渦旋震蕩混勻。 2) 如果多個(gè)樣品一起操作,Buffer GL 和無(wú)水乙醇可以等比例混勻后一起加入樣品。3)加入Buffer GL 和無(wú)水乙醇后可能會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,不會(huì)影響后續(xù)操作。 6. 將步驟5中所得到的溶液全部加入到已裝入收集管的吸附柱中,若以此不能加完溶液,可分多次轉(zhuǎn)入。10000rpm 離心 1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 7. 向吸附柱中加入 500μl Buffer GW1(使用前檢查是否已加無(wú)水乙醇),10000 rpm 離心 1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。 8. 向吸附柱中加入 500μl Buffer GW2(使用前檢查是否已加無(wú)水乙醇),10000 rpm 離心 1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中。如需進(jìn)一步提高DNA純度,可重復(fù)步驟8。 9. 12000rpm 離心 2min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱置于室溫?cái)?shù)分鐘,以徹底晾干。 注意:這一步的目的是將吸附柱中殘余的乙醇去除,乙醇的殘留會(huì)影響后續(xù)的酶促反應(yīng)(酶切,PCR等)。 10. 將吸附柱置于一個(gè)新的滅過(guò)菌的離心管中,向吸附柱的中間部位懸空加入50-200μl Buffer GE或滅菌水,室溫放置2-5min,10000rpm 離心 1min,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。注意:1)如果下游實(shí)驗(yàn)對(duì)PH值或EDTA敏感,可以用滅菌水洗脫,洗脫液的PH值對(duì)洗脫效率有很大影響,若用水作洗脫液應(yīng)保證其PH值在7.0-8.5直 接,PH值低于7.0時(shí)洗脫效率不高。 2)離心前室溫孵育5min可增加產(chǎn)量。 3)用另外的50-200μL Buffer GE或滅菌水再次洗脫可以增加產(chǎn)量。 4)如果需要提高DNA的終濃度,可以將步驟10所得的DNA洗脫液重新加至吸附膜上,重復(fù)步驟10;若洗脫體積小于200μL,可以增加DNA的終濃度,但可能會(huì)減少總產(chǎn)量。 二、PCR PCR程序設(shè)定:根據(jù)轉(zhuǎn)基因類型及引物設(shè)計(jì)而改變 設(shè)定PCR反應(yīng)體系 先在1.5ml的EP管中加入總的體系再平均分裝入各個(gè)PCR管中(一般多加兩小管的量),將移液器調(diào)到總量的1/3到1/2體積在EP管中緩慢抽吸若干次(盡量避免產(chǎn)生氣泡)以便Taq酶混合均勻,最后再在各PCR管中依次加入DNA樣品。 引 物處理方法:引物合成后,EP管上會(huì)有標(biāo)記,一般為x nmol,使用前先用12000rpm 離心 1min,加入10x μl ddH2O,渦旋振動(dòng)混勻,微型離心機(jī)離心,即可得到100μM的母液,取10μl 的母液,用ddH2O稀釋10倍,即加入90μl,混勻后即可得到10μM的引物工作液。 三、 電泳 1. 配膠:鑒定用的膠板有大、中、小3種,分別用的梳子為50、25、11齒。分別用的0.5*TBE的量為90ml、45ml、25ml。用1.5%的瓊脂糖凝膠。 2. 點(diǎn)樣:12μl的DNA,Marker加5μl。點(diǎn)樣時(shí)注意逐個(gè)點(diǎn)樣,不要點(diǎn)錯(cuò),最好把中間的那個(gè)孔留著點(diǎn)Marker,這樣可避免點(diǎn)樣的出錯(cuò)。Marker的選擇依基因片段大小而定。 3. 跑電泳:打開(kāi)電源,150v電壓,30min左右即可。 4. 照膠:看是否有目的條帶,即可判斷對(duì)應(yīng)小鼠是陽(yáng)性、陰性或是雜合子。 5. 保存。 |
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