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歐寶寶的魚新蟲 (初入文壇)
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[求助]
請問Amber中cluster的用法
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各位大神好！請問amber中，我想使用兩個(gè)原子間的距離進(jìn)行聚類，該如何輸入命令？ 我看到 https://amberhub.chpc.utah.edu/cluster/ 網(wǎng)頁中的Distance Metric Options提到了dme 和pairdist 。請問該怎么理解？特別是這個(gè)using atoms in <mask>. mask中的atom指的是什么？ dme [<mask>] Distance between frames calculated using distance-RMSD (aka DME, distrmsd) using atoms in <mask>. [pairdist <file>] File to use for loading/saving pairwise distances. |
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