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醫(yī)學(xué)生物科研銅蟲 (小有名氣)
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[交流]
發(fā)表SCI論文，圖片處理技巧要掌握！
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科學(xué)論文中,圖片占有重要的地位,可以說是論文是否被接受的關(guān)鍵之一。文字有點(diǎn)長，但請務(wù)必耐心看完…… 01 文章中的圖片操作的三大原則 1)原始圖像要保留,修改后的圖像務(wù)必另存而不要覆蓋原始圖像; 2)盡量減少保存次數(shù),以免損失圖像質(zhì)量,可以多處修改一一完畢后再做存盤; 3)所有操作不得使圖像失真,任何影響圖像真實(shí)性的修改都是不允許的。 02 拼圖要求 不可能直接在原始圖片上做上述修改,一般都要將若干張圖片或圖片的部分在一張畫布上進(jìn)行分布,需經(jīng)過素材收集-拼合-標(biāo)注等步驟,因此在這里稱之為拼圖。此步在獲得原始圖片之后進(jìn)行,完成后再參照第一部分作修改。 標(biāo)注: 標(biāo)注的內(nèi)容主要包括bar條、箭頭等突出符號、編號等。 1)bar條 利用Photoshop作bar條,需要采集和原始照片同等放大倍數(shù)下的標(biāo)尺照片。這可以通過在不同放大倍數(shù)的物鏡下拍攝游標(biāo)卡尺的標(biāo)準(zhǔn)刻度來做到,注意游標(biāo)卡尺的厚度應(yīng)與樣品的厚度一致,可通過加墊片來解決。同時(shí)打開樣品照片和標(biāo)尺照片,在較大的比例縮放下,用矩形選框工具仔細(xì)選擇一段標(biāo)尺,將此框移到樣品照片上,右鍵選擇填充黑色,將此bar層移到合適的位置后合并圖層。注意bar的放大縮小必須于圖片同時(shí)等比例,否則將失去意義。時(shí)間bar一般由采樣軟件給出,在此就不討論了。 2)箭頭 Photoshop中繪制箭頭可能較其它一些專業(yè)的圖像分析軟件煩瑣一些。在左手邊的快捷鍵面板上選擇 自定義形狀工具(有的顯示為 直線工具,按扭右下角擴(kuò)展三角中可改變),菜單欄下的工具定義欄中 形狀:下拉框中可選擇三種不同形狀的箭頭,選中后在圖片窗口中拖動(dòng)就可畫出箭頭。不過這三種箭頭的形狀不是慣常的形狀。最常用的三角、燕尾、平腳箭頭可以用另一方法畫出:點(diǎn)選 直線工具,點(diǎn)右邊的下拉小三角出現(xiàn)箭頭參數(shù)選單,勾選箭頭位置(不勾則劃直線),寬度、長度、凹度分別為500%、500%、0時(shí)可畫出三角;500%、1000%、25可畫出燕尾;500%、1000%、0可畫出平角。畫出的箭頭都分別占一層,可各自移動(dòng)到合適位置,要?jiǎng)h除也可用刪除層的方法,排列合適后拼合圖層。箭頭用來突出顯示需要讀者注意的地方,也可用其它方式,如加框等,這些都可以用Photoshop方便的完成,這里就不贅述了。 3)編號 利用左手邊的快捷鍵面板上的“文字工具”可以方便的添加文字及字母,點(diǎn)擴(kuò)展三角還可以選擇橫排文字還是豎排。建議英文字體選擇 Arial,較Times New Roman更清晰。編號、坐標(biāo)值等文字信息可以放到修改圖片大小及分辨率之后做,可避免文字變得不清晰,也可防止有時(shí)單調(diào)長或?qū)挾刮淖肿兪蓍L或矮胖。添加的文字也單獨(dú)成層,最后注意拼合圖層。 01 關(guān)于原始圖像的獲取 任何修改工作都是在原始圖像的基礎(chǔ)上進(jìn)行,如果原始圖像質(zhì)量不佳,那必將事倍功半。下面對有利于原始圖像質(zhì)量的細(xì)節(jié)略做介紹。因?yàn)椴煌瑏碓吹膱D像,其注意點(diǎn)也不一樣,因此分開。 1)來自照相的獲得的數(shù)碼文件多是在顯微鏡視野下采集的,因此聚焦和暴光是必須要考慮的。顯微鏡下景深極淺,意味著聚焦清晰不能依賴于小光圈,而應(yīng)靠精細(xì)調(diào)節(jié)顯微鏡。注意應(yīng)使照相通道和目鏡觀察通道相一致,即目鏡下最清晰時(shí)也是拍照最清晰的,以方便拍照。拍照時(shí)相機(jī)應(yīng)選擇最大光圈,廣角端。不要使用望遠(yuǎn)變焦,它使得視野變小且放大倍數(shù)難以計(jì)算。聚焦不清的另一主要問題在于相機(jī)的抖動(dòng)。雖然一般相機(jī)都固定在顯微鏡上,但按快門時(shí)的手震有時(shí)仍不可忽視,這時(shí)一個(gè)簡單的辦法是利用相機(jī)的自拍功能,按下快門之后經(jīng)倒數(shù)計(jì)時(shí)后正式拍攝。一般明視野下,利用相機(jī)的自動(dòng)暴光都能達(dá)到要求;暗視野下有時(shí)需要高達(dá)幾分鐘的暴光時(shí)間,這是一般數(shù)碼相機(jī)達(dá)不到的,只能通過專業(yè)的CCD系統(tǒng)并用軟件幫助采集圖像。一些軟件可以用來修改暴光不足的照片,但暴光過度往往使圖像細(xì)節(jié)丟失。顯微鏡下拍攝時(shí)閃光燈不起作用,將它關(guān)閉。通過白平衡,一般不會產(chǎn)生嚴(yán)重的偏色。另外,由于鏡頭的原因,邊角處難免會有失真,因此,請保證目標(biāo)在視野正中,鏡頭成像最佳范圍內(nèi),而無須鋪滿整個(gè)視野,現(xiàn)在的數(shù)碼相機(jī)的像素值已經(jīng)足夠高了。 2)來自采樣軟件的采樣軟件所采得的原始圖形一般儲存在特定格式的文件中,通過該軟件或配套的分析軟件打開。有的采樣或分析軟件可以將圖形直接輸出到word或Photoshop中,但有的則不能。這時(shí)最簡單的辦法就是通過抓屏或抓圖軟件來獲取。通過采樣軟件獲取的圖形輸出后僅做些切割、拼合的工作,不應(yīng)該做更多其它的修改。圖形在采樣軟件中可以通過改變x:y軸的縮放比改變形狀,因此一組圖片應(yīng)該選擇統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),并且標(biāo)注x:y標(biāo)尺。圖形的精細(xì)程度和采樣頻率相關(guān),采樣頻率越高,圖片越精細(xì)。圖片中不必要的顏色信息可以在Photoshop中丟棄,圖像/調(diào)整/去色。 3)來自統(tǒng)計(jì)作圖軟件的 常用的統(tǒng)計(jì)作圖軟件包括origin、sigma plot等,功能非常強(qiáng)大,但一般應(yīng)用excel也可滿足。這些軟件作的圖一般都可直接輸出到word及Photoshop中(如excel,選中圖片,右鍵復(fù)制,打開Photoshop,新建,自動(dòng)跳出匹配的畫布大小,編輯/粘貼 即可),所以修改圖片應(yīng)多在統(tǒng)計(jì)軟件中,輸出后不宜多做修改。圖中盡量不要用顏色或灰度來區(qū)別組間,而多利用形狀特征。如excel的柱狀圖,選擇“填充/圖案”,里面有足夠多的選擇項(xiàng)。各統(tǒng)計(jì)作圖軟件功能強(qiáng)大,超出了本文敘述的范圍,就不多說了。 雜志社對投稿圖片的分辨率通常有如下要求:TIFF: Colour or greyscale photographs (halftones): always use a minimum of 300 dpi. TIFF: Bitmapped line drawings: use a minimum of 1000 dpi. 第一點(diǎn)說的是灰度圖的dpi在至少300dpi以上,比如病理圖片、電泳圖等; 第二點(diǎn)說的是點(diǎn)陣線性圖的分辨率一般在1000dpi以上,比如用excel所作曲線或柱狀圖,chemdraw所畫結(jié)構(gòu)式等。投稿所遇到的問題:通常數(shù)碼照片的dpi為72而excel所作圖片的dpi為200均不能滿足投稿需求,因此要更改dpi 設(shè)置解決方法:在photoshop新建一個(gè) A4格式的圖片,在圖片大小選項(xiàng)中將分辨率選為雜志所需的分辨率(比如1000ppi,這里可能又涉及到一個(gè)ppi和dpi的概念,其實(shí)你不用多管,簡單說來,一個(gè)相當(dāng)于電腦屏幕的輸出(ppi),一個(gè)相當(dāng)于打印機(jī)的輸出(dpi),你只要ppi設(shè)為1000,打印的分辨率就為1000dpi,兩者在數(shù)值上是等量的)。將excel或照片直接粘貼到新建圖層中(注意,這是的圖片顯示的可能會很小),將圖片放大到適合觀看的大小,剪切所需區(qū)域,如果雜志社對圖片大小有要求可以通過圖片大小選項(xiàng)設(shè)定(例5cm*3cm),保存為tiff格式,將保存layer前的對鉤去掉,確定,采用LZW壓縮,確定,即可。這樣保存的圖片大約為200k.dpi增大的優(yōu)點(diǎn):通常我們用excel作的圖貼到word或直接保存為圖片,會發(fā)現(xiàn),圖片縮小會比較清初,但是放大后遍模糊 將 dpi增大后,雖然縮小圖片感覺不如直接保存清初,但是你放大很多倍后圖像仍清晰。 如果原圖是用“Origin”做的曲線圖,按照要求“1200 dpi (dots per inch) for black and white line art (simple bar graphs, charts, etc.)”的要求修改過程如下  1)將所做的圖用程序“Origin” (如OriginPro 7.5)打開;(2)點(diǎn)擊菜單”File” “Export Page..” 在“保存類型”中選“Tag Image File(*.tif)”,同時(shí)在 “Show Image Options”前打勾 , 確定“保存”;(3)在TIFF Options窗口中,“DIP” 設(shè)為1200;“Color Depth” 選Monochrome;“Compression” 選LZW,最后點(diǎn)擊“OK”即可。(4)將所得的TIF格式圖片用Photoshop打開,在菜單“圖像”, “圖像大小”中確認(rèn) “分辨率”為1200象素/英寸,將“寬度”設(shè)定為6000像素左右;點(diǎn)擊“好”。(5)“文件”, “存儲為”,“格式”選為“TIFF”,“保存”;在“圖像壓縮”中選“LZW”; 點(diǎn)擊“OK”;就可獲得滿足雜志要求的圖片了!如果圖片是JPG等照片,如電鏡照片等,300 dpi for halftones (black and white photographs)600 dpi for combination halftones (photographs that also contain line art such as labeling or thin lines)按照上面的任一個(gè)要求,處理如下: (1)圖片用Photoshop打開,在菜單“圖像”中的 “圖像模式”中選擇“灰度”(用于黑白圖片)或者“CMYK”(用于彩色圖片) (2)在“圖像”中的“圖像大小”設(shè)定“分辨率”為600(或300)象素/英寸,將“寬度”設(shè)定為3000像素左右;點(diǎn)擊“好”。 (3)“文件”-“存儲為”-“格式”選為“TIFF”-“保存”;在“圖像壓縮”中選“LZW”; 點(diǎn)擊“好”;就可獲得滿足雜志要求的圖片了。 |
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