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zzy329372570銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助，使用amber18的cpptraj從軌跡文件中提取rst文件缺少速度。
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我想使用cpptraj從動(dòng)力學(xué)軌跡文件中提取某一幀作為下一個(gè)動(dòng)力學(xué)窗口的起始rst文件。指令操作如下：cpptraj parm model.prmtop trajin xxx.cdf 2000 2000 1 trajout 2000.rst7 restart go 結(jié)果會(huì)生成一個(gè)2000.rst文件，但是我在使用這個(gè)文件進(jìn)行下一步計(jì)算的時(shí)候，會(huì)報(bào)錯(cuò)，ERROR: I could not find enough velocities in 13.5.rst7 此外，用這個(gè)指令生成的rst7文件大小與動(dòng)力學(xué)自動(dòng)保存的rst文件大小也不同。 想請(qǐng)問(wèn)下這是什么原因��？應(yīng)該怎么修改cpptraj指令呢？謝謝~！ |
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zzy329372570
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2樓2021-04-23 18:38:29
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3樓2021-04-23 18:43:20
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zzy3293725704樓2021-04-23 18:44:07
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5樓2021-04-23 18:47:47
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6樓2021-04-23 19:47:56
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