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ji115826新蟲 (小有名氣)
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[求助]
我想問一下重新組裝基因組要怎么弄
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如果想要重新組裝一個(gè)物種的基因組，因?yàn)閰⒖蓟蚪M和我的品種之間差異比較大，想重新組裝基因組，那都需要采用什么測(cè)序方法，測(cè)多少X， @starseacow 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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不知道你想研究的是啥物種，測(cè)序方法是de novo測(cè)序（從頭測(cè)序）主要針對(duì)基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種，構(gòu)建不同類型的基因組DNA文庫，并進(jìn)行序列測(cè)定。然后使用生物信息學(xué)方法對(duì)序列進(jìn)行拼接、組裝和注釋，從而繪制該物種完整的基因組序列信息。簡單基因組：重復(fù)序列低于50%，且二倍體雜合度低于0.5%的物種。 復(fù)雜基因組：重復(fù)序列高于50%，或二倍體雜合度高于0.5%，或其他多倍體物種。至于測(cè)多少×，還跟你研究的物種的基因組大小，重復(fù)序列，雜合度等有關(guān)，三代測(cè)序也可以測(cè)，上海派森諾生物可以做。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2021-04-22 17:31:14
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