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聽楓沛凝新蟲 (正式寫手)
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[求助]
easyfig軟件使用問題
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各位老師好，最近做了全基因組測序，想把結(jié)果用easyfig軟件來進(jìn)行基因環(huán)境比較，但是這個(gè)軟件在運(yùn)行blast環(huán)節(jié)的時(shí)候出現(xiàn)了點(diǎn)問題，情況如下： 用網(wǎng)站上面的例子1運(yùn)行，如果用自帶的blastn.out文件（大約3kb）就可以地出來正確的圖片，但是如果用在軟件中自己生成的blast.out軟件，就是0kb，畫出來的圖也是只有基因，沒有陰影部分的比較，所以比較困惑，如果要用這個(gè)軟件blast的話，怎么操作？或者是否有其他軟件可以生成這種blast.out的文件? |
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0077110088
新蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 生物信息學(xué)
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您好您好 我在linux安裝了Gcluster 但是在準(zhǔn)備輸入文件的地方 遇到了一些困難 就是首先Genbank文件 因?yàn)槲业氖删w大部分都是自己分離的測序得到的 所以沒有從NCBI上下載下來的那么規(guī)范 不清楚基因組必須帶的注釋包括哪些呀？ 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
7樓2022-08-03 16:02:02
nanhu1984
銀蟲 (正式寫手)
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自己下載一個(gè)blast，安裝后進(jìn)行本地blastn分析，設(shè)置結(jié)果展示格式為表格形式，即可得到blastn.out文件 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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聽楓沛凝
2樓2021-04-05 22:36:13
聽楓沛凝
新蟲 (正式寫手)
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3樓2021-04-08 13:56:57
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4樓2022-06-17 22:49:56
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