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YXMivy鐵蟲 (初入文壇)
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如何用gaussian view 給每個原子設(shè)定不同的基組 已有1人參與
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| 如何用gaussian view 給每個原子設(shè)定不同的基組。想要對分子吸附金屬進行sers分析。但不知道如何分別的待測分子和金屬團簇設(shè)定不同的基組。還有待測分子與金屬團簇吸附的鍵怎么表示 |
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paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+10 2021-03-16 17:08:45
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zhou2009: 金幣+10 2021-03-16 17:08:45
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關(guān)于基組的問題可以直接用自定義基組的方式定義。高斯中既可以用原子的種類 也可以用分子中各個原子的的序號給不同的原子用不同的基組。比如下面例子中的苯酚 比如我想讓苯環(huán)上的c 和 h 還有oh上的 o h 分別都是不同的基組 可以寫成如下 %chk=d:\bz_oh_hybrid_basis.chk # b3lyp/genecp opt title card required 0 1 c -0.16903625 -0.55266579 0.00221280 c 1.22612375 -0.55266579 0.00221280 c 1.92366175 0.65508521 0.00221280 c 1.22600775 1.86359421 0.00101380 c -0.16881725 1.86351621 0.00053480 c -0.86641825 0.65531021 0.00153080 h -0.71879525 -1.50498279 0.00266280 h 1.77563175 -1.50517879 0.00352780 h 3.02334175 0.65516521 0.00284680 h -0.71893925 2.81579721 -0.00041820 h -1.96602225 0.65549321 0.00135080 o 1.94147582 3.10174018 0.00093708 h 2.10101280 3.37960484 -0.90401551 c 0 6-31g(d) **** 10 11 7 8 9 0 6-31+g(d,p) **** o 0 def2tzvp **** 13 0 aug-cc-pvtz **** 這樣就可以做到 不同種類的原子比如 c 和 o用不同的基組 也可以對于 同一個種類的原子 但是處于不同位置 用它們的序號給它們用不一樣的基組。如果有ecp 那么ecp的部分也是同理。用序號或者原子在這分子中的序號來設(shè)定不同的基組。 至于鍵 高斯中的鍵本事并無化學(xué)含義 所以你可以按照你自己的想法隨意畫上去就可以。你可以在它們之間設(shè)置虛線之類的。 |
2樓2021-03-16 11:32:41
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