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Core/shell partner atom not found是什么原因？
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大家好！我用lammps計算BaTiO3材料，用的core/shell模型。參考了手冊的in文件寫法，出現(xiàn)了錯誤“Core/shell partner atom not found”。手冊的解釋是Could not find one of the atoms in the bond pair. 我一直沒想明白是哪里出了問題。尋求大家的幫助，十分感激。 data文件是 LAMMPS Description 1250 atoms 625 bonds 6 atom types 3 bond types 0 20.0500011445000 xlo xhi 0 20.0500011445000 ylo yhi 0 20.0500011445000 zlo zhi Masses 1 47.867 2 0.0001 3 137.327 4 0.0001 5 15.9994 6 0.0001 Atoms 1 1 1 4.7600 2.0050 2.0050 2.0050 2 1 2 -1.5800 2.5050 2.5050 2.5050 3 2 3 5.6200 0.0000 0.0000 0.0000 4 2 4 -3.7600 0.5000 0.5000 0.5000 5 3 5 0.9100 0.0000 2.0050 2.0050 6 3 6 -2.5900 0.5000 2.5050 2.5050 （...） Bonds 1 1 1 2 2 2 3 4 3 3 5 6 4 3 7 8 5 3 9 10 （...） in文件是 units real atom_style full boundary p p p #read_restart restart.6523 read_data BaTiO3-5x5x5.dat run_style verlet group cores type 1 3 5 group shells type 2 4 6 compute CSequ all temp/cs cores shells fix thermoberendsen all temp/berendsen 300 300 100 fix thermostatequ all nve fix_modify thermoberendsen temp CSequ comm_modify vel yes velocity all create 300.0 134 bias yes temp CSequ velocity all scale 300.0 temp CSequ pair_style buck/coul/long/cs 10.0 pair_modify shift yes pair_coeff * * 0.0 1.0 0.0 pair_coeff 2 6 104378.5 0.25239 0.0 #Ti-O pair_coeff 4 6 19935.1 0.38729 0.0 #Ba-O pair_coeff 6 6 94604.04 0.29581 300.0 #O-O kspace_style pppm 1.0e-4 bond_style harmonic bond_coeff 1 7401.852 0.0 bond_coeff 2 5787.741 0.0 bond_coeff 3 2335.158 0.0 thermo_style custom step vol press pe epair ebond ecoul enthalpy temp thermo_modify temp CSequ thermo 100000 timestep 1 fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 100 drag 2.0 dump 1 all xyz 100000 all.xyz run 1000000 unfix 1 |
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4樓2022-05-03 13:25:27
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