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餓的神啊新蟲 (著名寫手)
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[求助]
預(yù)測蛋白的全長CDS擴增 已有1人參與
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用NCBI上公布的預(yù)測蛋白的DNA序列作為模板,設(shè)計了用于擴增全長CDS的引物,TA克隆后隨機挑了3個克隆測序,結(jié)果比模板多出將近200bp,除去多出的序列,別的都能比對上,但是翻譯成氨基酸的時候有很多終止密碼子,最長的ORF(frame3)比模版對應(yīng)的少近30aa。 我的目的是擴增全長CDS,用于構(gòu)建載體,這種情況下,我應(yīng)該以NCBI上的預(yù)測序列為參考,還是實際測序所得序列(3個克隆間序列100%一致),求各位解惑! 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
至尊木蟲 (文壇精英)
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