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zengjiarui新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
誠(chéng)心請(qǐng)教：兩株菌的16S測(cè)序結(jié)果很相似，可以算是同一株菌嗎？謝謝！ 已有4人參與
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| 分離了一些腸球菌，27F和1492R引物對(duì)擴(kuò)增測(cè)序后，發(fā)現(xiàn)它們的序列信息很相似，很多只在序列的首尾部分有一些不同堿基，請(qǐng)教一下它們會(huì)是同一株菌嗎？非常感謝！ |
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2樓2021-01-08 16:47:36
嘟嘟熊levi
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3樓2021-01-08 20:19:36
zengjiarui
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4樓2021-01-08 20:26:26
zengjiarui
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5樓2021-01-08 20:27:58
6樓2021-01-08 23:13:35
doukezhiwu
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7樓2021-01-11 23:22:22
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8樓2021-01-12 23:07:21
minghong222
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【答案】應(yīng)助回帖
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zengjiarui: 金幣+30, ★★★★★最佳答案 2021-01-14 10:02:29
zengjiarui: 金幣+30, ★★★★★最佳答案 2021-01-14 10:02:29
| 將16S測(cè)序結(jié)果去掉頭尾峰值較差的堿基后，將你測(cè)得的幾株菌序列在NCBI中進(jìn)行兩兩比對(duì)，看一下相似性到底有多高，如果相似性在99%以上，那證實(shí)是同一個(gè)種。在這個(gè)前提下，如果同一個(gè)樣品、同一種培養(yǎng)基上挑取純化的菌落，基本上可以證實(shí)是同一株菌；但如果是在不同樣品、不同分離培養(yǎng)基下挑取的菌株，即使相似性是在99%以上，也只能證實(shí)是同一個(gè)種，但不能證實(shí)是同一株菌。如果想進(jìn)一步證實(shí)是否是同一株菌，就要將這幾株菌在同等條件下，一起進(jìn)行生理生化實(shí)驗(yàn)，如果生理生化實(shí)驗(yàn)相同，可以證實(shí)是同一株菌。 |
9樓2021-01-13 09:30:36
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小冀-: 金幣-10, 屏蔽內(nèi)容, 違規(guī)存檔, 本版塊禁止發(fā)一切形式的廣告、鏈接及聯(lián)系方式 2021-01-19 16:18:59
小冀-: 金幣-10, 屏蔽內(nèi)容, 違規(guī)存檔, 本版塊禁止發(fā)一切形式的廣告、鏈接及聯(lián)系方式 2021-01-19 16:18:59
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10樓2021-01-13 21:27:39
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