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nkleof銀蟲(chóng) (正式寫手)
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[求助]
結(jié)合vtst的vasp5.4.1運(yùn)行報(bào)錯(cuò)
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編譯了帶vtst的vasp5.4.1，編譯完成沒(méi)有出錯(cuò)，進(jìn)行靜態(tài)計(jì)算也沒(méi)問(wèn)題，但是在做NEB計(jì)算的時(shí)候總是走了兩個(gè)離子步之后就報(bào)錯(cuò)：forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred，奇怪的是把CONTCAR復(fù)制成POSCAR之后，也還是走兩個(gè)離子步就報(bào)這個(gè)錯(cuò)誤。 已經(jīng)設(shè)置ulimit -s unlimited，用ulimit -s 查詢結(jié)果是unlimited 編譯時(shí)用了OFLAG = -O1，而且在FFLAGS后面加上-heap-arrays 64，同樣報(bào)錯(cuò)。 以下是makefile.include: # Precompiler options CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC91_ompi\" -DIFC \ -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \ -DMPI_BLOCK=8000 -DscaLAPACK -Duse_collective \ -DnoAugXCmeta -Duse_bse_te \ -Duse_shmem -Dtbdyn CPP = fpp -f_com=no -free -w0 $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS) FC = mpif90 FCL = mpif90 -mkl FREE = -free -names lowercase FFLAGS = -assume byterecl -heap-arrays 64 OFLAG = -O1 OFLAG_IN = $(OFLAG) DEBUG = -O0 MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64 BLAS = LAPACK = BLACS = -lmkl_blacs_openmpi_lp64 SCALAPACK = $(MKL_PATH)/libmkl_scalapack_lp64.a $(BLACS) OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o INCS =-I$(MKLROOT)/include/fftw LLIBS = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS) OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o OBJECTS_O2 += fft3dlib.o # For what used to be vasp.5.lib CPP_LIB = $(CPP) FC_LIB = $(FC) CC_LIB = gcc CFLAGS_LIB = -O FFLAGS_LIB = -O1 FREE_LIB = $(FREE) OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o # Normally no need to change this SRCDIR = ../../src BINDIR = ../../bin 以下是.bashrc里的設(shè)置： source /opt/intel/bin/compilervars.sh intel64 export PATH=/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/bin/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/bin/intel64_mic:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/debugger/gui/intel64:/opt/torque/6.1.1.1/bin:/opt/torque/6.1.1.1/sbin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/opt/openmpi-1.6.5/bin/:/root/bin ulimit -s unlimited export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi-1.6.5/lib/ 編譯器用的是intel的composer_xe_2013.5.192，并行編譯用的openmpi-1.6.5，求幫忙指點(diǎn)一下問(wèn)題出在哪里。 |
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nkleof
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