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可視化的最低能量路徑繪制程序MEPplot測(cè)試版本發(fā)布
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各位同仁,大家好。 最近我開發(fā)了一個(gè)能量最低路徑繪制的可視化程序,它叫MEPplot。 該程序旨在解決在勢(shì)能面(自由能面)上繪制最低能量路徑。 繪制能量最低路徑在計(jì)算化學(xué)與分子動(dòng)力學(xué)模擬領(lǐng)域有一定的需求。截至目前(2020年11月26),我暫時(shí)沒發(fā)現(xiàn)一個(gè)集成的軟件包可以處理。 該程序基于 string method。在幾年前我發(fā)布過一個(gè)指令行版本,該版本難用而且不穩(wěn)健。因此將幾年前的程序做可視化并且對(duì)算法穩(wěn)定性進(jìn)行修改。 他還在測(cè)試過程中,可能有一些bug和設(shè)計(jì)缺陷。懇請(qǐng)各位同行在本貼下方提出問題,或者在項(xiàng)目的GitHub issue區(qū)提交問題。 程序發(fā)布網(wǎng)頁: https://github.com/chenxin199261/MEPplot |
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