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| 【懸賞金幣】回答本帖問(wèn)題，作者Yolanda9288將贈(zèng)送您 20 個(gè)金幣 | ||
Yolanda9288新蟲 (小有名氣)
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[求助]
gromacs計(jì)算速度
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實(shí)驗(yàn)室有兩臺(tái)工作站，cpu相同，均沒(méi)有g(shù)pu，只有內(nèi)存差別，一個(gè)256g，一個(gè)384g，但是我在兩臺(tái)機(jī)器上計(jì)算一樣的模型速度差別很大，內(nèi)存高的快很多，但我看計(jì)算時(shí)，內(nèi)存占用率并不高，cpu占用率都是一樣的，是什么原因呢？慢的那臺(tái)是不是安裝gromacs的時(shí)候哪里設(shè)置不對(duì)，還是計(jì)算速度與內(nèi)存關(guān)系很大？望高手指點(diǎn) 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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2樓2020-09-23 22:57:57
3樓2020-09-23 23:00:49
4樓2020-09-23 23:09:10
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跟內(nèi)存條數(shù)量可能有關(guān)系。不知道你的cpu型號(hào)，我們最近配置了一臺(tái)96線程的工作站，我這個(gè)cpu貌似是16通道的，所以在傳輸數(shù)據(jù)的時(shí)候，如果16個(gè)內(nèi)存條都插滿，就可以一起傳輸。但是如果沒(méi)有插滿，比如只有10個(gè)，那其他6個(gè)傳輸?shù)臅r(shí)候，就要先等那10傳輸完，再傳輸。所以10跟16g的內(nèi)存雖然一共有160g的內(nèi)存，但是傳輸速率還不如16個(gè)4g的，雖然后者只有前者不到一半的內(nèi)存。就好比，你拿10量卡車把16本書運(yùn)送到16個(gè)地方，就不如我用16個(gè)小火車運(yùn)送16本書。反正總量始終是超過(guò)的，那個(gè)數(shù)就很重要了。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2020-09-23 23:10:14
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小貨車。。。 說(shuō)的不太嚴(yán)禁，大概是這個(gè)意思。 所以你看下你們的內(nèi)存條是不是插滿了，沒(méi)有的話插滿，可能會(huì)好一點(diǎn)。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
6樓2020-09-23 23:12:01
Yolanda9288
新蟲 (小有名氣)
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非常感謝您的回復(fù)，我今天看了下我們的工作站，其中一臺(tái)16個(gè)插槽，插了12個(gè)32g的內(nèi)存條，總共384g，另一臺(tái)也是16個(gè)插槽，插了16個(gè)16g的內(nèi)存條，總共256g但是有四個(gè)插槽識(shí)別不了，可能是壞了，可用只有192g，也就是12個(gè)16g，跟那臺(tái)電腦插的內(nèi)存條數(shù)量應(yīng)該是一樣的，只有單個(gè)內(nèi)存條大小不一樣，但是運(yùn)行速度確實(shí)慢很多倍，我們的cpu都是一樣的，型號(hào)是Intel Xeon E5-2630 v3 2.4GHz *2 16核 32線程，還是不知道什么原因慢5倍左右  |
7樓2020-09-24 13:31:35
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