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yangyue5678銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化之前如何掃描 已有2人參與
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求助各位大神，我做了個分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化，有條審稿意見是 The studied molecule can present several minina, a scan on the dihedral angle 4-3-10-15 is necessary before proceeding to the other calculations. 請問這個scan要怎么做呢？謝謝大家 |
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yangyue5678
銅蟲 (小有名氣)
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4樓2020-07-21 22:42:59
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yangyue5678: 金幣+35, ★★★很有幫助 2020-07-21 22:43:11
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yangyue5678: 金幣+35, ★★★很有幫助 2020-07-21 22:43:11
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具體方法可以看我這個教程的1.10.3節(jié) http://m.gaoyang168.com/t-14242735-1，具體如截圖。 同時這個帖子的附件6就是一個如何用GaussView設(shè)置柔性掃描的動圖。 QQ截圖20200721091154.png |
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3樓2020-07-21 21:16:31
paramecium86
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| 所謂掃描的意思是 高斯按照你設(shè)置的變量 每隔一個角度或者長度算一次能量然后把它們畫成一張圖。你可以看到能量隨著你掃描的變量變化的曲線 這個曲線出現(xiàn)的低點就是可能存在的穩(wěn)定結(jié)構(gòu) 。你把所有可能的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)都做一次結(jié)構(gòu)優(yōu)化 算出來能量 比較一下誰高誰低 或者用boltzman distribution算算看每一個穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的占比是多少 |
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5樓2020-07-21 23:01:38
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