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yyy941020鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
求教如何得知EST-SSR位于基因組區(qū)域哪個位置
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在一些文獻(xiàn)上看到他們用ncbi查找知道SSR位于5’或3’UTR,或者CDS。請問如何操作呢?我只有開發(fā)這個標(biāo)記的轉(zhuǎn)錄組序列。拿去NCBI上預(yù)測一下ORF就可以了嘛?是拿最長的ORF做判斷呢?還是要看是不是ssr不在所有預(yù)測的ORF里才算他在UTR。謝謝! 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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