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| 【懸賞金幣】回答本帖問(wèn)題,作者一只科研豬將贈(zèng)送您 5 個(gè)金幣 | ||
一只科研豬新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
求助PGAP (prokaryotic genome annotation pipeline)使用教程
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求助,用PGAP怎么進(jìn)行基因組注釋?zhuān)靠梢圆幌螺d軟件,只在它的網(wǎng)頁(yè)上輸入結(jié)果進(jìn)行比對(duì)嗎? 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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這是ncbi基因組提交系統(tǒng)內(nèi)部的一個(gè)基因組注釋工具,你可以把基因組提交ncbi,選擇pgap注釋你的基因組,設(shè)定公布基因組的時(shí)間即可 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |

新蟲(chóng) (初入文壇)
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我想再問(wèn)一下您知道如果從ncbi上下載一個(gè)基因組自己模擬一下怎么用pgap注釋要怎么操作?因?yàn)楹笃谖易约阂矔?huì)做基因組,所以想拿已有的數(shù)據(jù)先練練手 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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這個(gè)是沒(méi)有辦法模擬的,因?yàn)槟愕幕蚪M提交ncbi時(shí),系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)和數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因組進(jìn)行比對(duì)分析,如果發(fā)現(xiàn)是一模一樣,ncbi會(huì)提出質(zhì)疑,需要你進(jìn)行解釋 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |

新蟲(chóng) (初入文壇)
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我看了b站上一個(gè)pgap的教程,他說(shuō)可以在基因組提交到ncbi之前先用pgap進(jìn)行注釋。所以我想著是不是能下載一個(gè)已知的基因組試著用pgap注釋一下。還是說(shuō)在locally用pgap進(jìn)行分析僅限于還未提交到ncbi的數(shù)據(jù),不能下載已經(jīng)體檢過(guò)的數(shù)據(jù)分析? 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
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