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基于Materials Studio的異質(zhì)結(jié)構(gòu)建模技巧
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Materials Studio是美國Accelrys公司生產(chǎn)的新一代材料計(jì)算軟件。Materials Visualizer模塊提供了搭建分子、晶體及高分子材料結(jié)構(gòu)模型所需要的所有工具，可以操作、觀察及分析結(jié)構(gòu)模型，處理圖表、表格或文本等形式的數(shù)據(jù)，并提供軟件的基本環(huán)境和分析工具以及支持Materials Studio的其他產(chǎn)品，是Materials Studio產(chǎn)品系列的核心模塊。本文將講解異質(zhì)結(jié)建模的一些技巧。 首先，導(dǎo)入石墨烯的結(jié)構(gòu)。在ms自帶的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫中有一個(gè)可以使用的金屬Au結(jié)構(gòu)。然后按照同樣的方法導(dǎo)入第二個(gè)結(jié)構(gòu)，在這里以金屬Ag為例。 接著，我們通過Lattice Parameters工具分別查看兩個(gè)基本結(jié)構(gòu)的晶胞參數(shù)： 接下來就是表面的建立。在軟件中，我們采用Build—Surface—Cleave Surface工具對晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)行切表面處理。 對于石墨烯，我們首先確定切面，該教程中以（0 0 1）面進(jìn)行講解。點(diǎn)擊cleave即可得到表面。對于金，我們采用同樣的切表面的方式進(jìn)行切表面處理，又以金是是矩形面，我們只需要設(shè)置暴露晶面即可。我們通過Lattice Parameters工具分別查看兩個(gè)基本表面的晶胞參數(shù) 我們可以看出，Au和Ag的（001）晶面的參數(shù)分別是4.0857和4.0783，像差很�。�10%），我們可以直接采用Build—Build Layer工具進(jìn)行異質(zhì)結(jié)結(jié)構(gòu)的搭建。在Dedine Layers 面板選擇兩個(gè)表面，注意此時(shí)兩個(gè)表面結(jié)構(gòu)應(yīng)該激活。點(diǎn)擊Matching面板，我們可以選擇以Layer 1，Layer 2或者平均值作為構(gòu)建的基準(zhǔn)。點(diǎn)擊Build即可得到組合后的結(jié)構(gòu)。 對于異質(zhì)結(jié)結(jié)構(gòu)，我們還可以通過修改z軸，來對結(jié)構(gòu)添加真空層。使用Lattice Parameters工具，在Advanced面板上，取消keep并在Parmeters面板上設(shè)置z軸長度即可。 最后，歡迎通過微信公眾號聯(lián)系我們。 微信公眾號：320科技工作室。 |
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