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[求助] 請(qǐng)問(wèn)G4方法能不能算的動(dòng)三四十個(gè)原子的分子已有1人參與

請(qǐng)問(wèn)G4方法能算的動(dòng)三四十個(gè)原子的分子結(jié)構(gòu)嗎。我看別人的文獻(xiàn)中用G4算乙基咔唑的能量，可是我跑了15個(gè)小時(shí)了，還沒(méi)有算完，目前的狀態(tài)是opt結(jié)束了，后面就一直卡著沒(méi)結(jié)果，實(shí)際上只算了7個(gè)小時(shí)。用的服務(wù)器，36核算的。我的輸入文件如下：
# G4 geom=connectivity

necz

0 1
C                -1.14579300 0.49395000 -0.00001300
C                -0.96842200 -0.91454000 0.00001300
C                0.45961100 -1.15076200 0.00000700
C                1.10413000 0.12488100 -0.00002000
N                0.10752000 1.12339000 -0.00002400
C                1.21791600 -2.32663400 0.00002200
C                2.60766900 -2.24443400 0.00000500
C                3.23702200 -0.98827700 -0.00003000
C                2.50542400 0.19988000 -0.00004100
C                -2.42249000 1.06833400 -0.00002600
C                -3.52355000 0.21048700 -0.00000800
C                -3.36228800 -1.18688000 0.00002100
C                -2.08817400 -1.75394600 0.00003100
C                0.18141300 2.59551500 -0.00007000
C                1.57214900 3.22560800 0.00011600
H                0.72562900 -3.29068700 0.00004600
H                3.20564100 -3.14553000 0.00001300
H                4.31787600 -0.93431500 -0.00004600
H                3.03074100 1.13873800 -0.00007000
H                -2.56474100 2.13969000 -0.00005200
H                -4.52066400 0.63070900 -0.00001900
H                -4.23598900 -1.82446300 0.00003300
H                -1.96889900 -2.82973300 0.00005100
H                -0.36611100 2.95292500 -0.87792300
H                -0.36635300 2.95297800 0.87761000
H                1.45424700 4.31072200 0.00011700
H                2.14403100 2.95805300 0.88734700
H                2.14426000 2.95809000 -0.88698100

1 2 1.5 5 1.0 10 1.5
2 3 1.5 13 1.5
3 4 1.5 6 1.5
4 5 1.0 9 1.5
5 14 1.0
6 7 1.5 16 1.0
7 8 1.5 17 1.0
8 9 1.5 18 1.0
9 19 1.0
10 11 1.5 20 1.0
11 12 1.5 21 1.0
12 13 1.5 22 1.0
13 23 1.0
14 15 1.0 24 1.0 25 1.0
15 26 1.0 27 1.0 28 1.0
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1樓 2020-06-12 11:02:12

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護(hù)發(fā)專家: 金幣+10, ★★★★★最佳答案 2020-06-12 13:48:14

G4 在熱力學(xué)組合方法里都是高端的存在。20多個(gè)原子左右基本已經(jīng)是差不多的上限了，里面涉及到了MP4 以及 CCSD(T)的步驟�？焓强隙ú豢斓�。慢慢等著就行。一般30核心左右的，15,6個(gè)原子左右的可能跑上一個(gè)小時(shí)差不多。原子數(shù)目翻一倍那計(jì)算時(shí)間翻到50， 60倍差不多。40個(gè)原子恐怕就很難算的動(dòng)了。

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2樓2020-06-12 12:33:27

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【答案】應(yīng)助回帖

至于cpu使用率低是因?yàn)?post-HF方法需要大量的讀取寫(xiě)入硬盤。cpu在那里就是干等著的硬盤越快 cpu的效率就越高。

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3樓2020-06-12 12:34:38

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引用回帖:

2樓: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-12 12:33:27
G4 在熱力學(xué)組合方法里都是高端的存在。20多個(gè)原子左右基本已經(jīng)是差不多的上限了，里面涉及到了MP4 以及 CCSD(T)的步驟�？焓强隙ú豢斓�。慢慢等著就行。一般30核心左右的，15,6個(gè)原子左右的可能跑上一個(gè)小時(shí)差不 ...

原來(lái)如此，難怪卡在昨晚凌晨四點(diǎn)就再也不動(dòng)了，非常感謝，請(qǐng)問(wèn)前輩，像我這種大分子，有沒(méi)有推薦的熱力學(xué)組合方法，G3方法在現(xiàn)在來(lái)看是不是有些過(guò)時(shí)了？ps. 我暫時(shí)用的36核，學(xué)校服務(wù)器一般一個(gè)人最多調(diào)用72核，不然會(huì)被別的人噴、。。

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4樓2020-06-12 13:33:14

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引用回帖:

4樓: Originally posted by 護(hù)發(fā)專家 at 2020-06-12 00:33:14
原來(lái)如此，難怪卡在昨晚凌晨四點(diǎn)就再也不動(dòng)了，非常感謝，請(qǐng)問(wèn)前輩，像我這種大分子，有沒(méi)有推薦的熱力學(xué)組合方法，G3方法在現(xiàn)在來(lái)看是不是有些過(guò)時(shí)了？ps. 我暫時(shí)用的36核，學(xué)校服務(wù)器一般一個(gè)人最多調(diào)用72核，不 ...

G3確實(shí)過(guò)時(shí)了。高斯內(nèi)置的方法里 G4MP2 和 CBS-QB3 性價(jià)比比較高。比G4快不少。不過(guò)即使是這兩種方法 30個(gè)原子也基本是上限了。

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5樓2020-06-12 13:43:58

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引用回帖:

5樓: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-12 13:43:58
G3確實(shí)過(guò)時(shí)了。高斯內(nèi)置的方法里 G4MP2 和 CBS-QB3 性價(jià)比比較高。比G4快不少。不過(guò)即使是這兩種方法 30個(gè)原子也基本是上限了。...

好的好的，謝謝前輩，我用G4MP2和CBS-QB3提交兩個(gè)任務(wù)試試

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6樓2020-06-12 13:47:00

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6樓: Originally posted by 護(hù)發(fā)專家 at 2020-06-12 00:47:00
好的好的，謝謝前輩，我用G4MP2和CBS-QB3提交兩個(gè)任務(wù)試試...

如果還算不動(dòng)，那就試試 G3MP2B3 這個(gè)還能再快些但是精度也低些。CBS-4M 基本是高斯支持的方法里最快的�？梢运阍訑�(shù)能多一點(diǎn)點(diǎn) 但是精度比前幾個(gè)可要低不少了。

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7樓2020-06-12 14:00:52

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7樓: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-12 14:00:52
如果還算不動(dòng)，那就試試 G3MP2B3 這個(gè)還能再快些但是精度也低些。CBS-4M 基本是高斯支持的方法里最快的�？梢运阍訑�(shù)能多一點(diǎn)點(diǎn) 但是精度比前幾個(gè)可要低不少了。...

好的好的，非常感謝前輩，那我就再提交兩個(gè)任務(wù)，我現(xiàn)在就是在篩選一個(gè)合適的方法

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8樓2020-06-12 14:27:09

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