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Yongqi琦鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
分子對(duì)接,在pymol中形成pdb復(fù)合物后,查看相互作用力問題(氫鍵)
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| 使用Autodock vina做完對(duì)接后,導(dǎo)入pymol軟件查看配體與蛋白的氫鍵作用,按照教程說的find-polar contacts-to other atoms in objects,卻沒有顯示除氫鍵。但是直接導(dǎo)入原配體蛋白又可以顯示氫鍵關(guān)系,請(qǐng)問有人知道如何處理該問題么?我在對(duì)接前處理蛋白,加的是全氫,不是極性氫,有關(guān)系么? |
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