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關(guān)于分子對接前,金屬蛋白酶的預處理問題,急求解答 已有1人參與
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請問分子對接前處理金屬蛋白酶,必須提前做氨基酸質(zhì)子化那些么?我是用Autodock Tool處理蛋白,目前只做了加氫,計算電荷等不走,不知道還需要做哪些步驟進行優(yōu)化更好? 還有一個問題就是關(guān)于金屬電荷,autodocktool識別不了金屬離子,然后我是在pdbqt文件手動加上了電荷,但是,在做對接時根本用不了,說無效文件,請問有誰指導該怎么處理么? 謝謝各位大佬指導 |
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