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如何在液/固混合相的npt系綜中固定固相原子?
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最近需要模擬一個液體/固體混合相體系,其中固體材料要保持不動,試了幾個方法都不行,急求請高手指點? 首先做一個nvt系綜收縮原子,模擬1ns左右后發(fā)現(xiàn),邊界上出現(xiàn)真空層,于是考慮加一個npt系綜使模擬盒子收縮,但是實際情況時體系要么膨脹要么崩潰。 1. fix fnpt1 solv npt temp 300 300 100.0 z 1.0 1.0 1000 couple none dilate solv drag 1.0 使用上述命令,體系直接蹦了,solv是液相group 2. fix fnpt1 solv npt temp 300 300 100.0 z 1.0 1.0 1000 couple none drag 1.0 去掉dilate solv,體系倒是能算,但是體積翻倍了,同時固相材料也跟著膨脹了,不知道什么原因。 這里因為是二維固體材料,所以couple none,希望固定固相材料和模擬盒子x與y兩個維度,只讓盒子在z方向上伸縮。請問哪里不對呢? 辛苦高手們指點一二,謝謝啦 |
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