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ljh06新蟲 (正式寫手)
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高斯溶劑化全優(yōu)化 已有1人參與
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高斯溶劑化全優(yōu)化后跑單點,與氣相中優(yōu)化后跑單點有什么不一樣。為什么要溶劑化全優(yōu)化呢。求老師解答 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
版主 (著名寫手)
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最重要的不同就是因為溶劑的作用,溶劑中的分子的結(jié)構(gòu)能跟氣相中不太一樣。既然結(jié)構(gòu)不同,那得到的能量肯定會有不同。 從原理上來說,這里你說的高斯的溶劑化,指的應該是高斯自帶的隱式溶劑模型。在隱式溶劑模型下,溶劑分子都被看成連續(xù)的可極化介質(zhì)。溶劑對于對于溶質(zhì)分子會有極化作用。這部分作用在隱式溶劑模型中被加到了Fock 算符里,成為了解波函數(shù)的一部分。被稱為 SCRF。 所以解出來的最優(yōu)化波函數(shù)就跟氣相中不同。導致影響這個分子算出來的所有性質(zhì)都會跟氣相中有不同。 還有一種就是顯式溶劑模型,就是真的在計算中把溶劑分子分層擺在溶質(zhì)分子周圍,再進行計算。這樣優(yōu)化出來直接就顯示了溶劑分子跟溶質(zhì)分子如何作用。但這樣非常耗時。建模也很困難。 |
新蟲 (正式寫手)
版主 (著名寫手)
| 如果你在溶劑模型下僅僅做一個單點,而不再做結(jié)構(gòu)優(yōu)化,那你的前提就是:你要算的分子的結(jié)構(gòu)在溶劑中和在氣相中是相同的。通常,中性分子確實可以忽略掉溶劑化之后的分子結(jié)構(gòu)的變化。但是如果你的分子本身帶電荷,通常結(jié)構(gòu)會有比較大變化。應該重新在溶劑模型下做優(yōu)化才能得到準確的結(jié)構(gòu)和能量。而如果你不確定你的分子在氣相和溶液中是否會發(fā)生很大的結(jié)構(gòu)變化,那你就還是重新在溶劑模型下優(yōu)化一下才比較保險。 |
新蟲 (正式寫手)
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