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小x要努力新蟲 (初入文壇)
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[求助]
生物信息學(xué)問題如何實(shí)現(xiàn)根據(jù)某一氨基酸序列對(duì)其他物種的氨基酸序列進(jìn)行編號(hào)？ 已有1人參與
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非生物信息學(xué)專業(yè)，但是做了生物信息學(xué)的畢業(yè)設(shè)計(jì)想找大佬請(qǐng)教一下。 想請(qǐng)教一下這個(gè)文獻(xiàn)當(dāng)中的，根據(jù)牛視紫紅質(zhì)氨基酸對(duì)其他物種中的opsin序列進(jìn)行編號(hào)，是什么意思，怎樣才能做到？謝謝 文獻(xiàn)原文如下： “得到的候選視蛋白氨基酸序列的用 clustal w軟件進(jìn)行多重序列比對(duì)，并根據(jù)牛視紫紅質(zhì)氨基酸（lLH， Palczewski等，2000； Teller等，2001）對(duì)其他物種中 opsin序列的氨基酸位置進(jìn)行編號(hào)�！� |
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candlelight1
金蟲 (正式寫手)
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2樓2020-03-21 20:05:24
小x要努力
新蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)
送紅花一朵 |
您好，我還想問一下，因?yàn)槲椰F(xiàn)在做的是通過幾個(gè)功能相同的同源蛋白序列來篩選某個(gè)物種中該功能蛋白序列， 在用blast的時(shí)候，可以多個(gè)同源蛋白放在一個(gè)文件當(dāng)中進(jìn)行篩選還是要逐個(gè)比對(duì)？如果是逐個(gè)比對(duì)，如何對(duì)每個(gè)同源序列得到的蛋白如何處理，比如是取交集還是并集？ 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
3樓2020-03-22 20:39:08
冷血孤峰
銀蟲 (小有名氣)
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- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
4樓2020-05-19 08:04:01
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