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秦紫蓉新蟲 (初入文壇)
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[求助]
DNA序列上傳NCBI問題求解
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在NCBI上傳動(dòng)物COI序列后收到NCBI如下郵件，望有經(jīng)驗(yàn)前輩賜教，該如何解決。本人比較外行，DNA提取擴(kuò)增后都是由測序公司測序拼接的，對基因序列中存在的問題也不太清楚。NCBI郵件如下： We have received the following 57 sequence submissions from you: SUB7027792 : (57) Some or all of the protein coding sequences contain reading frame shifts (insertions/deletions based on BLAST similarity search results and/or an alignment), and/or have translations that show little or no similarity to other proteins in the database. This generally indicates problems such as: - errors in the nucleotide sequence - sequences have not been trimmed of low quality - problems with feature annotation which may be due to: translation in the wrong reading frame or on the wrong strand translation does not have the correct exon spans translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's Provide a corrected submission file through the Submission Portal: |
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2樓2020-04-07 00:51:58
weebug
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3樓2020-04-07 09:58:11
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4樓2021-03-24 15:09:36
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5樓2023-07-12 17:53:48
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