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zhangyujin銅蟲 (正式寫手)
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[交流]
Gromacs能否取出多少距離以內(nèi)的構(gòu)型 已有4人參與
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| 請問大家，如果關(guān)注的是小分子在蛋白內(nèi)的光學性質(zhì)，用GROMACS跑完動力學，如何能取出小分子所在一定范圍內(nèi)，比如5埃之內(nèi)的構(gòu)型呢？主要是考慮到這個距離以外的原子對分子性質(zhì)影響不大。 |
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3樓2019-12-31 16:13:21
cjl123321
銅蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 1977.6
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- 專業(yè): 生物物理、生物化學與分子
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用gmx distance計算小分子與蛋白的距離隨時間的變化，通過得到的數(shù)據(jù)能知道那些時間段小分子和蛋白的距離小于5A，然后去對應(yīng)的觀看這些時間段對應(yīng)的結(jié)構(gòu)即可 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2019-12-07 14:58:39
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4樓2020-01-02 17:17:28
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