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amber動力學(xué)模擬時，怎么讓底物周圍氨基酸的側(cè)鏈位置更準(zhǔn)確呢
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| 大家好，請教大家一個關(guān)于對酶蛋白進(jìn)行動力學(xué)模擬的問題，amber動力學(xué)模擬時，怎么讓底物周圍氨基酸的側(cè)鏈位置更準(zhǔn)確呢，雖然是參考了野生型的側(cè)鏈位置，但是突變體的沒有晶體結(jié)構(gòu)（只突變了催化口袋內(nèi)2-3個關(guān)鍵氨基酸），模擬的結(jié)果不穩(wěn)定，前10ns挺穩(wěn)定的，但是再續(xù)跑30ns時，輔因子位置變化會很大，或者底物位置變化會很大，有沒有好的方法啊，謝謝。 |
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6樓2020-01-02 09:45:43
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7樓2020-01-03 11:13:28
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8樓2020-01-04 14:59:03
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9樓2020-01-07 11:17:31
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10樓2020-01-09 11:09:38
11樓2020-05-19 08:52:33
簡單回復(fù)
2019-11-14 15:16
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2019-11-15 16:32
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tzynew4樓
2019-11-18 21:49
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psylhh5樓
2019-11-21 00:21
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