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Gjiao新蟲 (初入文壇)
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我想問一下帶環(huán)狀結(jié)構(gòu)的鍵解離能怎么算?舉個(gè)例子就環(huán)己烷,打開鍵前opt+freq,打開鍵后再opt+freq?再兩者相減?開鍵后opt結(jié)構(gòu)會拉直,這樣結(jié)構(gòu)不是變化了很多嘛? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (初入文壇)
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環(huán)狀的結(jié)構(gòu)會比較麻煩。 拿環(huán)己烷舉例的話 可以人為的通過沿著一個(gè)C-C鍵旋轉(zhuǎn)二面角 把一個(gè)C轉(zhuǎn)到另外一側(cè) 人為的讓鍵斷掉 再算能量。(這里所說的能量都指的是 焓或者是零點(diǎn)校正后的電子能,所以要進(jìn)行頻率計(jì)算。)這樣比直接拉成直的更加接近真實(shí)的BDE。 不過這樣做的話就需要考慮兩個(gè)事情 1. 鍵斷開后生成的是一個(gè)雙自由基單重態(tài)的分子。 需要考慮用片段組合去計(jì)算雙自由基的能量。 2. 這樣做涉及到一個(gè)單鍵的轉(zhuǎn)動。需要建立一個(gè)模型(比如說 這里可以用 正己烷同樣旋轉(zhuǎn)一個(gè)單鍵) 計(jì)算單鍵轉(zhuǎn)動的能量。 這樣 BDE=環(huán)己烷能量-開環(huán)后結(jié)構(gòu)能量-單鍵轉(zhuǎn)動能 另外 就環(huán)己烷來說還有一種方法就是 ,既然每個(gè)c-c鍵的鍵能是一樣的。那直接切斷兩根鍵。變成兩個(gè) CH2-CH2-CH2 的雙自由基結(jié)構(gòu) 。用環(huán)己烷能量減去兩個(gè)CH2-CH2-CH2的能量 得到的就是兩個(gè)鍵的BDE,直接除以2就可以得到每一個(gè)鍵的BDE了。這個(gè)做法會比較容易操作。 |
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環(huán)狀的結(jié)構(gòu)會比較麻煩。 拿環(huán)己烷舉例的話 可以人為的通過沿著一個(gè)C-C鍵旋轉(zhuǎn)二面角 把一個(gè)C轉(zhuǎn)到另外一側(cè) 人為的讓鍵斷掉 再算能量。(這里所說的能量都指的是 焓或者是零點(diǎn)校正后的電子能,所以要進(jìn)行頻率計(jì)算。)這樣比直接拉成直的更加接近真實(shí)的BDE。 不過這樣做的話就需要考慮兩個(gè)事情 1. 鍵斷開后生成的是一個(gè)雙自由基單重態(tài)的分子。 需要考慮用片段組合去計(jì)算雙自由基的能量。 2. 這樣做涉及到一個(gè)單鍵的轉(zhuǎn)動。需要建立一個(gè)模型(比如說 這里可以用 正己烷同樣旋轉(zhuǎn)一個(gè)單鍵) 計(jì)算單鍵轉(zhuǎn)動的能量。 這樣 BDE=環(huán)己烷能量-開環(huán)后結(jié)構(gòu)能量-單鍵轉(zhuǎn)動能 另外 就環(huán)己烷來說還有一種方法就是 ,既然每個(gè)c-c鍵的鍵能是一樣的。那直接切斷兩根鍵。變成兩個(gè) CH2-CH2-CH2 的雙自由基結(jié)構(gòu) 。用環(huán)己烷能量減去兩個(gè)CH2-CH2-CH2的能量 得到的就是兩個(gè)鍵的BDE,直接除以2就可以得到每一個(gè)鍵的BDE了。這個(gè)做法會比較容易操作。 |
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