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[求助]
二維勢能面掃描 已有1人參與
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模擬乙醇的雙質(zhì)子遷移過程，形成H3O+離子 想通過勢能面掃描找到過渡態(tài)，在輸入文件里我寫了兩個鍵的掃描，為什么做出來只有一個鍵在掃描，無法做出二維的勢能面呢？ 輸入文件內(nèi)容如下，還麻煩前輩予以解答，感謝 %mem=800mb %chk=c:\users\administrator\desktop\7848 scan.chk # opt=modredundant ub3lyp/3-21g 7848 1 2 c 1.25301900 -0.21453200 0.00000200 h 2.06684200 0.51703000 -0.00001700 h 1.35262400 -0.85227900 -0.88757500 h 1.35263500 -0.85224600 0.88760200 c -0.05441600 0.51378900 0.00000100 h -0.20455700 1.20893300 -0.86899300 h -0.20456000 1.20896100 0.86896700 o -1.18318200 -0.38763100 -0.00000300 h -2.08914100 0.07510400 0.00002600 b 7 8 s 10 -0.206443 b 4 8 s 10 -0.272655 |
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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| 應(yīng)該是沒有掃完中間就出錯了 所以只能看到幾個點(diǎn)。 很明顯的就是 這是要掃描4 和 8 之間的 7 和 8 之間的距離 從你的初始坐標(biāo)來看 他們分別相距2.72A 和 2.06A 也就說 這個掃描是要從現(xiàn)有的原子間距離距離上掃描到0 埃。 這肯定是不可能的實(shí)現(xiàn)的。O---H之間的距離 不會小于0.8A左右的 所以應(yīng)該是 掃到這個地方就會停掉。因?yàn)楦臼諗坎涣�。掃描鍵長跟角度不一樣 是有最小值的。是不能掃到0的。 |
2樓2019-10-07 00:32:21
3樓2019-10-08 14:41:45
4樓2019-10-08 18:33:10
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