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吧啵face新蟲 (初入文壇)
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[求助]
NCBI確定序列中的起始密碼子和終止密碼子 已有1人參與
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本人外行一個，求助各位大神幫幫忙，怎么用NCBI找出PRL基因序列的外顯子個數(shù)，內(nèi)含子剪切點(diǎn)還有起始密碼子和終止密碼子 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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舉個例子：查詢human PRL這個基因，點(diǎn)下面那個鏈接（如果是別的物種，用ncbi的gene數(shù)據(jù)庫找） https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/5617， 1.外顯子個數(shù)，頁面搜索“Exon count” 2.真核內(nèi)含子剪接位點(diǎn)都是符合GU-AG法則的，就是 外顯子gu--------ag外顯子gu------ag外顯子 這種形式，gu-ag 就是剪接位點(diǎn)。 3.找起始/終止密碼子，頁面搜索“tools”，點(diǎn)擊下拉菜單選“sequence text view”，里面的序列淡紅色背景是外顯子（下邊對應(yīng)了氨基酸序列，綠色背景是內(nèi)含子），第一個密碼子就是ATG（M）就是起始密碼子，翻頁（next page）最后一個密碼子TAA（*）終止密碼子 |
2樓2019-09-23 12:26:25
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