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zmcwangyang鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[求助]
求助，用vina做分子對接才能同時(shí)對接多個(gè)配體小分子 已有3人參與
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| 新人求助，用vina做分子對接時(shí)怎么才能同時(shí)對接多個(gè)配體小分子，是更改conf.txt的內(nèi)容嗎？還是有其他的方法，謝謝 |
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一代米喲
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【答案】應(yīng)助回帖
| 樓主的意思是多個(gè)配體同時(shí)結(jié)合在口袋里吧？可以百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子對接(DOCK6)】計(jì)算教程，算完之后點(diǎn)擊按鈕，合成復(fù)合物，再用該復(fù)合物作為受體，對接新的配體。如此反復(fù)，就可以得到多個(gè)配體同時(shí)結(jié)合在口袋里的結(jié)果了。不過，這時(shí)候的打分是新配體與復(fù)合物的結(jié)合力，不是所有配體與蛋白的結(jié)合力之和。要想得到后者，還需要把對接后的配體再次做一個(gè)打分評價(jià)。詳情可以咨詢一下教程作者。 |
12樓2021-12-03 11:17:18
therotyonth
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2樓2019-07-27 21:24:00
zmcwangyang
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3樓2019-07-27 21:28:24
4樓2019-12-25 11:17:51
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