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shanks2017鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
追蹤原子
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| 想通過(guò)追蹤原子坐標(biāo)來(lái)計(jì)算泊松比,看了手冊(cè)可以用dump命令輸出原子坐標(biāo),關(guān)鍵是如何知道所選取的原子id?知道原子id后怎樣輸出它的坐標(biāo)呢? |
金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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dump可以custom選擇輸出指定group的id和xyz坐標(biāo) 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
鐵蟲(chóng) (小有名氣)
送紅花一朵 |
你好,謝謝你的回復(fù),我之前逛論壇看到有人發(fā)了下面這個(gè),說(shuō)是輸出原子坐標(biāo)的,分組然后輸出原子坐標(biāo),他中間加了compute csel gsel com,這個(gè)的意思應(yīng)該是計(jì)算原子坐標(biāo),但是我在手冊(cè)上并沒(méi)有找到這個(gè)相關(guān)的命令,你知道這個(gè)是什么意思嗎?你說(shuō)的輸出指定原子的坐標(biāo)跟這個(gè)一樣嗎? group gsel id 1 compute csel gsel com variable x equal c_csel[1] variable y equal c_csel[2] variable z equal c_csel[3] |
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