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怎么計(jì)算重金屬。 已有1人參與
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請(qǐng)問(wèn)各位蟲(chóng)友。能和我講述一下計(jì)算重金屬時(shí)候的口令么？以及步驟。小白向你鞠躬了。比如模擬計(jì)算三價(jià)鐵離子和水的作用。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
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paramecium86
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2樓2019-05-24 09:50:36
3樓2019-05-24 16:49:18
paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+8 2019-05-25 08:50:06
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zhou2009: 金幣+8 2019-05-25 08:50:06
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給你個(gè)例子，例如算一個(gè)帶Fe的分子 的結(jié)構(gòu)優(yōu)化頻率計(jì)算 如果想讓Fe是SDD基組，其他是6-311g(d,p)，則輸入文件為 %nproc=16 %mem=10GB %chk=1.chk #p opt freq b3lyp/genecp <<<<<<<關(guān)鍵詞部分 b3lyp泛函 全電子/贗勢(shì)混合基組 <<<<<<<<<<一定要空一行 Title Card Required <<<<<<<<<<一定要空一行 0 2 <<<<<<<電荷和多重度，之下是分子坐標(biāo) 這個(gè)坐標(biāo)可以把你的分子用gview畫(huà)出來(lái) 然后讓gview給出個(gè)坐標(biāo)直接復(fù)制過(guò)來(lái)用就行。 O 1.23641237 1.02449231 0.48357982 O 3.79340942 -0.41974574 0.40393821 C 1.28546627 -0.30626188 0.36753494 N 2.59517275 -1.04941707 -0.02178549 H 2.57396972 -1.96339548 0.38342297 C 0.00854381 -1.12716700 0.62673335 H 0.27531773 -2.09151263 1.00590241 H -0.60292444 -0.61901871 1.34282824 Fe 2.53412498 0.45179272 -1.25580654 C -0.77227654 -1.29148902 -0.69042946 H -1.65948890 -1.86185816 -0.51033706 H -1.03905046 -0.32714339 -1.06959852 H -0.16080829 -1.79963731 -1.40652435 <<<<<<<<<<一定要空一行 Fe 0 <<<<<<<先定義電子基組部分 最后要加一個(gè)0 SDD **** C H O N 0 6-311g(d,p) **** <<<<<<<<<<每個(gè)不同電子基組之間要用****作為分隔符，寫(xiě)完最后一個(gè)電子基組也要寫(xiě) <<<<<<<<<<一定要空一行 Fe 0 <<<<<<<<<<<這里開(kāi)始是贗勢(shì)部分 最后也要寫(xiě)個(gè)0 SDD <<<<<<<<<這里一定要有個(gè)空行 |
4樓2019-05-24 22:24:15
5樓2019-05-25 12:16:03
6樓2019-05-25 12:16:21
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