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被子植物353個單拷貝核基因靶向捕獲試劑盒-研究植物系統(tǒng)分類和進化的利器
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被子植物353個單拷貝核基因靶向捕獲試劑盒-研究植物系統(tǒng)分類和進化的利器 Plant Universal — Angiosperms 353 產(chǎn)品概述 myBaits Angiosperms 353是從600種被子植物中,篩選353個單拷貝核基因,作為捕獲序列,利用k-medoid聚類法設(shè)計靶向捕獲探針,生物素化的RNA探針長度120 bp,對被子植物的353個單拷貝核基因進行定向捕獲測序。平均每個物種覆蓋283個基因,所有被子植物至少覆蓋100個直系同源單拷貝核基因。每個物種至少靶向137 kbp,最大捕獲區(qū)域為250 kbp,另外覆蓋了212 kbp的非編碼區(qū)。 產(chǎn)品特點 低起始量-1 ng-3 μg,推薦100-500 ng 覆蓋廣-捕獲覆蓋整個目標(biāo)序列 兼容性-兼容NGS文庫制備,允許多個堿基錯配 高精度-近緣和遠(yuǎn)緣的個體或者種群精準(zhǔn)捕獲,不引入biases 低投入-節(jié)約時間成本和經(jīng)費成本 高通量-多個文庫同一反應(yīng)進行,每個反應(yīng)pooling 2-16個樣本 通用性-適用于被子植物的系統(tǒng)進化分析,建立DNA條形碼 產(chǎn)品應(yīng)用 系統(tǒng)發(fā)生學(xué) 進化關(guān)系的分析 內(nèi)含子測序 發(fā)現(xiàn)可變區(qū)域 DNA Barcoding 對目標(biāo)序列的富集程度進行評價 |
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