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ocina鐵桿木蟲 (著名寫手)
小菜蟲
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[求助]
Gaussview計(jì)算得到的紅外光譜圖縱坐標(biāo)轉(zhuǎn)換 已有1人參與
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| 紅外光譜圖縱坐標(biāo)是Transmittance或Absorbance，而用Gaussview計(jì)算得到的譜圖是紅外光譜圖縱坐標(biāo)是Epsilon。請(qǐng)問這兩種類型的圖如何切換？急求，謝謝 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+8 2019-04-10 10:05:23
ocina: 金幣+50, ★★★很有幫助 2019-04-10 19:40:07
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以下是我知道的 我對(duì)中間的一些數(shù)學(xué)操作也不是搞得太清楚。有啥錯(cuò)誤之處就到時(shí)候請(qǐng)大牛來指正了。定性的來說說。 實(shí)驗(yàn)的紅外光譜通常用的Abs和 T%。 要和高斯得到的振子強(qiáng)度掛鉤就得用到朗伯比爾定律 Abs=ε *c *L 這里面 c和L是和物質(zhì)分子本身沒有關(guān)系的 所以高斯不考慮 高斯給出的那個(gè)紅外強(qiáng)度實(shí)際上就是 跟ε掛鉤的。也就是你看到Gaussview里顯示的 Epsilon 這ε單位是 L /mol /cm 如果查看輸出文件， 計(jì)算出來的IR振子強(qiáng)度 單位是 KM/mol 而所謂一個(gè)振動(dòng)模式的振動(dòng)強(qiáng)度定義是 用頻率對(duì)ε 積分 對(duì)應(yīng)實(shí)驗(yàn)中的紅外光譜 實(shí)際上就是在某一個(gè)頻率范圍內(nèi)的吸光度（實(shí)驗(yàn)光譜中的峰面積） 做了積分之后 L/mol/cm 相當(dāng)于乘以一個(gè)頻率（cm-1。 那這樣量綱就變?yōu)榱?跟高斯生成的KM/mol 一樣的了。 回到計(jì)算上來。算出來的IR光譜是一個(gè)一個(gè)的振子強(qiáng)度 放在圖上就是一條豎線 沒有面積，所以看起來和實(shí)驗(yàn)肯定是不一樣的。所以這樣就需要反過來操作，也就是把這個(gè)豎線展寬。 把對(duì)應(yīng)的振子強(qiáng)度 用某種規(guī)則進(jìn)行展寬后的曲線每一點(diǎn)的縱坐標(biāo)就可以對(duì)應(yīng)ε，也就是摩爾吸光度。 IR的計(jì)算光譜通常是用洛倫茲函數(shù)來展寬。展寬之后的計(jì)算光譜就可以和實(shí)驗(yàn)光譜比較了。 既然涉及到展寬，那自己手算比較麻煩。Gaussview 是可以在程序里幫你展寬的，在光譜上點(diǎn)擊右鍵 properties里 只需要設(shè)置半峰寬就可以了 大家一般最關(guān)心的是IR光譜的橫坐標(biāo)也就是頻率。每個(gè)峰之間相對(duì)的峰面積比較也有些價(jià)值。因?yàn)檫@對(duì)應(yīng)了振子強(qiáng)度的大小。而縱坐標(biāo)abs或者T%本身的絕對(duì)數(shù)值一般就并不那么關(guān)心了。 |
2樓2019-04-10 02:02:19
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半峰寬主要還是根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果來的 要盡量讓擬合出來光譜貼近實(shí)驗(yàn)光譜就行。紅外峰的頻率單位一般來說都是波數(shù) 算出來和實(shí)驗(yàn)譜中橫坐標(biāo)單位波數(shù)是一樣的單位。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
4樓2019-04-10 11:05:08
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6樓2019-04-10 17:59:44
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7樓2019-04-10 19:39:30
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