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凌楓霜葉木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
OpenBabel 計(jì)算電荷，LAMMPS data file，OPLS-AA/Amber力場(chǎng)
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| 我在使用OPENBABEL GUI將分子pdb, mol2等格式文件轉(zhuǎn)化成LAMMPS data file,請(qǐng)問(wèn)原子電荷怎么計(jì)算？有人用過(guò)OPENBABEL嗎？或者大家有好的生成lammps data file的好方法嗎？體系很大，上萬(wàn)個(gè)原子，分子的部分電荷很難手動(dòng)修改。求各位幫助，不勝感謝！ |
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S-Loser
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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- 專(zhuān)業(yè): 特種醫(yī)學(xué)(航空、航天、航海
2樓2019-04-03 19:12:49
凌楓霜葉
木蟲(chóng) (小有名氣)
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3樓2019-04-05 01:59:40
S-Loser
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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4樓2019-04-05 09:12:16
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