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15930258036新蟲 (小有名氣)
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在溶液動力學(xué)模擬中,用amorohous cell建完盒子后,還需要優(yōu)化結(jié)構(gòu)嗎? 還沒有入行的小白,求指教 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
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專家經(jīng)驗: +1059 |
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沒有一定做的說法。 AC模塊構(gòu)建盒子時,一般構(gòu)建好之后會自動幾何優(yōu)化,最終呈現(xiàn)給你的結(jié)果,已經(jīng)是經(jīng)過幾何優(yōu)化的,當(dāng)然幾何優(yōu)化的精度不是很高。 人為設(shè)置不讓AC模塊自動優(yōu)化,直接跑MD,只要不報錯,也沒問題。 即便報錯,一般是說兩步之間的能量差或者位移差太大。 總之,為了避免上述報錯,穩(wěn)妥起見,自己先幾何優(yōu)化下,再跑MD。 不優(yōu)化直接跑,也不影響最終結(jié)果。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

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