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[交流]
問一個很基本的問題,分子動力學和統(tǒng)計力學的區(qū)別以及徑向分布函數(shù)所屬的學科
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最近小弟在看一些關于徑向分布函數(shù)的內(nèi)容,對其所屬的學科有些疑惑。看網(wǎng)上有些地方說是分子動力學中的(Molecular dynamics),而維基百科和百度百科卻說是統(tǒng)計力學中的(Statistical mechanics )。小弟對這個領域不是很了解,想知道分子動力學和統(tǒng)計力學有什么關系?個人理解是統(tǒng)計力學是分子動力學的基礎,不知道對不對? 另外,想在文章中介紹徑向分布函數(shù)的來源,究竟是說來自分子動力學好還是統(tǒng)計力學好呀?謝謝大家了! |
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個人的理解是:分子動力學是基于一個構(gòu)型在時間軸上受力、位移、速度的運算,統(tǒng)計力學是你需要計算一些宏觀物理量,比如壓力、密度、溫度、焓值,自由能等時,從微觀的參數(shù)向宏觀的轉(zhuǎn)化。比如你計算壓力,你不應該直接從微觀的角度,對一個原子求勢能,然后除以原子體積。正確的做法是,求一大堆原子的勢能和,然后對一大堆原子的體積求一階導,得到一幀的壓力值,然后重復同樣的步驟,對N幀的壓力值求平均(一般而言 N>25, 假設你的體系已經(jīng)平衡),這才是分子動力學模擬中用統(tǒng)計力學求物理值的方法。至于你說的RDF,個人覺得,如果是很多幀的RDF應該是統(tǒng)計力學,如果只是一幀的RDF,應該可以直接說是分子動力學的RDF. 希望以上對你有一些幫助! |
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學而不思則罔,思而不學則殆,百度百科之于學術,既不嚴謹,也不系統(tǒng),以百科為綱,不僅得不到任何好處,還有可能被帶偏。事實上只要認真學過統(tǒng)計物理,做過MD的人,不可能對這個概念產(chǎn)生模糊,一個是理想的理論模型,一個是基于理論模型的應用,一目了然。如果僅僅做過MD,只是知其然不知其所以然,心里總歸沒有底,這個數(shù)據(jù)為什么可以這樣得到?反之亦然。所以說不僅要積累理論,更重要的還是要盡早地投入實踐,不然無異于盲人摸象,事前一些模糊的概念,只要做一次其實就了然了 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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