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放逐孤島銅蟲 (小有名氣)
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lammps中fix_npt命令詳解
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我在使用fix_npt命令時,產(chǎn)生了以下疑問: fix 1 all npt temp 298 298 $(100.0*dt) iso 1.0 -200 1000.0 timestep 0.5 run 100 原型即: fix ID group-ID npt temp Tstart Tstop Tdamp iso Pstart Pstop Pdamp 這個是我的代碼段,我對Tdamp與Pdamp產(chǎn)生了疑問。比如壓力控制時,我在100個時間步內(nèi)讓壓力從1atm降到-200atm,后面的1000起什么樣的作用呢?或者說,有沒有一個公式包含Tstart,Tstop,Tdamp能夠描述壓力降低的過程呢?感謝各位蟲友 @smutao@smutao |
木蟲 (正式寫手)
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是時間間隔,它的倒數(shù)是頻率,影響的是溫度/壓強(qiáng)變化的快慢,一般自己估摸著取就行了,根據(jù)你的單位決定,如果變化太慢了就要調(diào)小,每個人習(xí)慣不一樣,1000可能太大了,有時候我在real單位會考慮25左右,視不同的體系和單位,這個值是可以設(shè)置到很小的,比如1.0甚至更小,要看你的需求和調(diào)試過程,而且你100步跑不到-200atm的話,步數(shù)還要加,但是要注意一點的是,MD中壓強(qiáng)的漲落是很大的,那么你很有可能體系的壓強(qiáng)一下變成-4000或者3000,這個1~-200如果只看壓強(qiáng)可能不是那么明顯,那就需要取多個點的平衡漲落做系綜平均了 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
銅蟲 (小有名氣)
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