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牛很牛新蟲 (小有名氣)
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[交流]
水分子模擬 已有5人參與
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我現(xiàn)在在做水分子的模擬，但是現(xiàn)在設(shè)置初始溫度為150，初始速度為400，但是運(yùn)行不幾步之后，水分子的溫度就為零了，然后整個系統(tǒng)中的分子都是在非常緩慢的移動，幾乎都不動。不知道問題所在，求大神指點(diǎn) 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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2樓2019-03-20 09:53:57
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幾乎不動的話就說明速度為0了呀，當(dāng)分子速度為0時統(tǒng)計出的溫度也就是0了。建議你把代碼貼出來看看。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
3樓2019-03-20 10:04:38
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4樓2019-03-20 10:06:18
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5樓2019-03-20 10:06:59
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###########initial setting ########### #fix fixshake1 suan shake 0.0001 5 0 b 1 2 3 4 a 1 2 3 #這一行有問題，要問 fix 10 suan rigid molecule velocity all create 400 49284 timestep 1.0 ############### compute ############# compute 1 Na temp compute 2 Cl temp compute 3 suan temp compute 4 water temp compute 5 all pe compute ake all ke compute energy all group/group suan thermo_style custom step temp c_1 c_2 c_3 thermo 1000 thermo_modify temp 1 fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 100.0 fix rec all recenter INIT INIT INIT dump 1 all custom 1000 ch0110.water id type x y z run 1000000 write_data restart.water |
6樓2019-03-20 10:08:25
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7樓2019-03-20 15:07:33
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8樓2019-03-20 22:00:03
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你用的什么單位，timestep設(shè)成1.0，而且你的fix nvp的tdamp又是100.0，那頻率怕不是1/100年 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
9樓2019-03-21 00:49:49
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10樓2019-03-21 08:46:26
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