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放逐孤島銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
lammps超聲波模擬設(shè)置 已有1人參與
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我的題目是使用lammps模擬超聲空化，我把體系分為兩部份，一部分為邊界區(qū)，一部分為主區(qū)。通過邊界分子的簡(jiǎn)諧運(yùn)動(dòng)來實(shí)現(xiàn)超聲波的傳遞進(jìn)而完成空化過程。但是我在計(jì)算了大約20多個(gè)簡(jiǎn)諧運(yùn)動(dòng)周期后，主區(qū)內(nèi)的分子依然不動(dòng)，僅僅是邊界區(qū)的分子在進(jìn)行簡(jiǎn)諧運(yùn)動(dòng)。而且出現(xiàn)了 ERROR: Out of range atoms - cannot compute PPPM (src/KSPACE/pppm_tip4p.cpp:106) 這個(gè)錯(cuò)誤（我是用的是TIP4P水分子）。希望大家能幫助我，這是哪里出了問題呢，應(yīng)該如何修改，也歡迎各位做超聲空化的同僚前來交流，謝謝大家  我的in文件： dimension 3 boundary p p p units real atom_style full read_data b125.data group 1 read_data b2000.data add append group 2 neighbor 2 bin neigh_modify delay 0 every 1 pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.15 8.5 8.5 pair_coeff 1 1 0.1521 3.154000 8.5 pair_coeff * 2 0.000000 0.000000 8.5 bond_style harmonic bond_coeff 1 1000 0.9572 angle_style harmonic angle_coeff 1 3000 104.52 kspace_style pppm/tip4p 0.00001 minimize 1.0e-12 1.0e-12 1000 1000 variable vel equal 0.1*sin(2*PI*0.01*time) fix 1 1 move variable NULL NULL NULL v_vel NULL NULL timestep 0.001 dump 1 all atom 100 dump.lammpstrj run 500000 文件中1即為邊界區(qū)，2為主區(qū)。 |
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3樓2019-04-09 15:09:18
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