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2009云飛揚(yáng)鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
lammps中某個(gè)區(qū)域壓強(qiáng)的求解
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各位朋友，還是前面提到過(guò)的一個(gè)問(wèn)題。我建立了一個(gè)立方體，中心挖去原子形成一個(gè)球孔，在球孔中填入了另一種原子A，想求解球孔區(qū)域A原子所形成的壓強(qiáng)是多大，目前知道應(yīng)該局部壓強(qiáng)采用compute stress/atom 來(lái)計(jì)算（單位是能量——壓強(qiáng).體積），但是這樣就需要求解球孔區(qū)域A原子所形成的體積有多大，計(jì)算體積目前是采用的compute voronoi/atom 指令。但是在計(jì)算過(guò)程中總是覺(jué)得體積算的不對(duì)，相關(guān)的具體化指令如下，請(qǐng)知道的朋友幫忙指點(diǎn)指點(diǎn)，應(yīng)該怎么計(jì)算才能正確得到。先謝謝啦。 compute stress voidA stress/atom He_bubble compute stress1 voidA reduce sum c_stress[1] compute stress2 voidA reduce sum c_stress[2] compute stress3 voidA reduce sum c_stress[3] compute volum voidA voronoi/atom only_group variable p equal -(${c_stress1}+${c_stress2}+${c_stress3})/（3.0*c_volum） 體積計(jì)算部分是不是有問(wèn)題呢？希望知道的朋友能夠詳細(xì)說(shuō)說(shuō)，先謝謝啦 |
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木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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| 印象中compute voronoi/atom是唯一計(jì)算體系部分原子體積的方法，這個(gè)算法有些思路清奇，嚴(yán)格上說(shuō)可能不太準(zhǔn)確，可我用過(guò)一次，覺(jué)得精度還行。但在用之前你總要知道這個(gè)命令輸出了什么東西吧。剛才簡(jiǎn)單看了一下手冊(cè)，我有些記不清了，只能大致說(shuō)一下當(dāng)時(shí)是怎么做的。1)voronoi體積不是真正的體積，所以你是不是要V(總體積)*voronoi(A原子)/voronoi(所有原子)來(lái)得到A原子的體積？ 2)我記得這個(gè)命令輸出的不是單個(gè)的數(shù)，而是數(shù)組，好像還是二維數(shù)組，所以你是不是應(yīng)該輸出到一個(gè)文本看看它的輸出格式，把其中一個(gè)數(shù)組所有的結(jié)果加起來(lái)，甚至為了結(jié)果準(zhǔn)確，還要做一個(gè)系綜平均 |
9樓2019-03-12 14:36:24
2009云飛揚(yáng)
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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2樓2019-01-24 14:00:32
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3樓2019-01-24 18:47:04
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4樓2019-01-26 11:22:38
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