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njx銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
lammps real單位時(shí)間步問題
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我用real默認(rèn)的時(shí)間步模擬我的系統(tǒng)時(shí)模型變形比較大。導(dǎo)致原子miss。當(dāng)我調(diào)小時(shí)間步時(shí)就沒有這種情況。請(qǐng)問這是什么原因?qū)е碌哪�。感謝老師同學(xué)們幫忙！ 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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Nater1ver
木蟲 (正式寫手)
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恭喜你，都學(xué)會(huì)搶答了，看到你這問題的時(shí)候我都懵了。一般而言討論到步長(zhǎng)這里我覺得就夠了。再深究的話，以下是我的淺見，我推測(cè)就是跟運(yùn)動(dòng)方程積分算法有關(guān)，你要知道MD里面的時(shí)間是離散的，而不是連續(xù)的，最小的單位就是步長(zhǎng)，沒有比步長(zhǎng)更短的時(shí)間。考慮一個(gè)原子的運(yùn)動(dòng)，在兩個(gè)單位步長(zhǎng)內(nèi)，力場(chǎng)決定加速度，而速度的積分是位移，自然是步長(zhǎng)越大，位移越大，那么位移太大的原子可不就跑到盒子外面了嗎。唯一一點(diǎn)我沒搞懂的就是為什么周期性盒子中原子會(huì)丟失，也就是說可能原子位移是有上限值的，超過位移上限的原子即使在周期性邊界條件下一樣會(huì)丟失 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2019-01-13 23:58:31
njx
銅蟲 (小有名氣)
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3樓2019-01-14 18:02:15
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