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sincere32木蟲 (小有名氣)
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[求助]
不知道是DOS, basic, C或者python 求方向 手動(dòng)處理數(shù)據(jù)到批處理
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遇到N種情況， 例1 莖環(huán)結(jié)構(gòu)的探針設(shè)計(jì)。與目標(biāo)序列互補(bǔ)的序列約11-13個(gè)堿基，當(dāng)靶序列為100，就有A=（100-11+1）+（100-12+1）+（100-13+1）種可能的長(zhǎng)11-13個(gè)堿基的選擇，每一種有5種以上的莖結(jié)構(gòu)匹配，就是至少5A，每一個(gè)要試二級(jí)結(jié)構(gòu)，這一步有一個(gè)程序可以做，1要成莖環(huán)結(jié)構(gòu)，2自由能要在-2到-3之間，有個(gè)程序可以給出這兩項(xiàng)計(jì)算。手動(dòng)的話，一天都不一定能做完，同時(shí)每次計(jì)算要記錄，因?yàn)檫�要比較，至少自由能符合的其自由能值要記錄。希望可以解放，讓機(jī)器自動(dòng)做。 例2 比如長(zhǎng)約2000的序列，在某個(gè)物種的若干個(gè)個(gè)體之間，這段序列的若干位置的堿基有多于一種的選擇，或者說(shuō)是有突變。要在這段序列上設(shè)計(jì)檢測(cè)的引物，有程序可以接受序列給出引物，但不接受不確定的序列，而合成引物也是以確定的為好。所以，順序是設(shè)計(jì)引物最好避開突變。程序有一個(gè)特點(diǎn)，如果給它2000的序列和給它N個(gè)300的序列得出的結(jié)果可能后者會(huì)給出的選擇更多。這樣，1-300，50-350，然后再查有沒有突變的影響，兩件都是麻煩的事，希望機(jī)器做，幾步，第一，把序列分了，第二把分了的序列所對(duì)應(yīng)的位置記好，第三，把分了的序列代入程序，關(guān)鍵第三步不會(huì)，第四把結(jié)果記下，對(duì)照突變的位置。 這些表面一樣的都是大量重復(fù)的用程序處理的笨過程希望讓機(jī)器去做。 例3 類似上述過程，只是程序是網(wǎng)站提供的。 求指?jìng)�(gè)方向 也許可以是多個(gè)方向，最后如果可能，數(shù)據(jù)整理起來(lái)成庫(kù)也好。 多謝。不知道多少金幣合適。別嫌少。 |
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