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zht930528木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
麻辣王子
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[求助]
想做一個(gè)KEGG pathway的氣泡圖，某pathway的總基因數(shù)怎么找呢？
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如題。 比如顯著差異基因有90個(gè)，其中KEGG富集分析有8個(gè)參與A pathway， 在這個(gè)物種中有1萬(wàn)個(gè)基因，在這1萬(wàn)個(gè)基因里邊總共有多少個(gè)gene參與A pathway呢？ 可以怎么查找或解決？ |
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zht930528
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5樓2019-01-02 20:48:43
莫問(wèn)伯言
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如果是常見(jiàn)的物種，可以直接查詢(xún)?cè)撐锓N對(duì)應(yīng)的pathway，或者可以查詢(xún)?cè)損athway下所有基因，再挑出該物種的基因 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
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zht9305282樓2019-01-02 11:42:43
zht930528
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麻辣王子
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3樓2019-01-02 11:44:48
莫問(wèn)伯言
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笨方法：TCApathway中對(duì)應(yīng)的ko，在看ko對(duì)應(yīng)的基因。如果有對(duì)應(yīng)的關(guān)系列表更好解決。如果不急需的話，可私聊留一個(gè)郵箱 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
4樓2019-01-02 20:04:56
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