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acerabc新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[交流]
離子化合物模型構(gòu)建
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想計(jì)算a分子的吉布斯自由能,構(gòu)建了模型b,c是gauss優(yōu)化后的結(jié)構(gòu),b中O和K以共價(jià)鍵形式連接了,實(shí)際O和K應(yīng)該是以離子鍵形式連接,離子鍵應(yīng)該怎么在模型體現(xiàn)出來(lái)? a.png b.png c.png |
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版主 (著名寫(xiě)手)
| 高斯的計(jì)算是真空中的結(jié)構(gòu) 且電荷都是趨于平均化。也就是不太可能出現(xiàn)一個(gè)分子內(nèi)有完整分離的陰陽(yáng)離子對(duì)兒, 而是會(huì)算出讓電荷平均化后的分子(真空中出現(xiàn)電離的等離子態(tài)本就是很困難的)。要想規(guī)定一邊是陽(yáng)離子一邊是陰離子 那需要做Constrained DFT 這個(gè)NWchem這種程序支持。 如果是固體狀態(tài)下的離子化合物,那應(yīng)該用第一性原理的那些方法去計(jì)算了 而不是用高斯這類(lèi)量子化學(xué)計(jì)算軟件。 就高斯優(yōu)化出來(lái)的這個(gè)結(jié)構(gòu)是相對(duì)合理的。本來(lái)那個(gè)負(fù)電荷就是在兩個(gè)O上平均分配的幾乎。所以K應(yīng)該要基本在這兩個(gè)O中間其實(shí)沒(méi)有什么問(wèn)題。 |
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
送紅花一朵 |
老師您好,我想問(wèn)一下如果我想計(jì)算萘甲酸和氫氧化鉀反應(yīng)生成萘甲酸鉀和水這個(gè)反應(yīng)的吉布斯自由能,是否可以用高斯分別優(yōu)化這四個(gè)分子,分別得到他們的EE+thermal free energy correction,然后用萘甲酸鉀和水的EE+thermal free energy correction減去萘甲酸和氫氧化鉀的EE+thermal free energy correction。另如果反應(yīng)條件為500℃的高溫,反應(yīng)物升溫前是固體,我計(jì)算的機(jī)組為# b3lyp/6-311g(d,p) opt freq,這個(gè)設(shè)置是否還應(yīng)該做什么改變?比如是否加色散矯正?是否因?yàn)榉磻?yīng)物為固體而增加什么設(shè)置? |
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