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Yolanda9288新蟲 (小有名氣)
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[求助]
gromacs計(jì)算速度
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實(shí)驗(yàn)室有兩臺工作站,cpu相同,均沒有g(shù)pu,只有內(nèi)存差別,一個(gè)256g,一個(gè)384g,但是我在兩臺機(jī)器上計(jì)算一樣的模型速度差別很大,內(nèi)存高的快很多,但我看計(jì)算時(shí),內(nèi)存占用率并不高,cpu占用率都是一樣的,是什么原因呢?慢的那臺是不是安裝gromacs的時(shí)候哪里設(shè)置不對,還是計(jì)算速度與內(nèi)存關(guān)系很大?望高手指點(diǎn) 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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跟內(nèi)存條數(shù)量可能有關(guān)系。不知道你的cpu型號,我們最近配置了一臺96線程的工作站,我這個(gè)cpu貌似是16通道的,所以在傳輸數(shù)據(jù)的時(shí)候,如果16個(gè)內(nèi)存條都插滿,就可以一起傳輸。但是如果沒有插滿,比如只有10個(gè),那其他6個(gè)傳輸?shù)臅r(shí)候,就要先等那10傳輸完,再傳輸。所以10跟16g的內(nèi)存雖然一共有160g的內(nèi)存,但是傳輸速率還不如16個(gè)4g的,雖然后者只有前者不到一半的內(nèi)存。就好比,你拿10量卡車把16本書運(yùn)送到16個(gè)地方,就不如我用16個(gè)小火車運(yùn)送16本書。反正總量始終是超過的,那個(gè)數(shù)就很重要了。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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