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Pd-DPPF螯合物Gaussian結(jié)構(gòu)優(yōu)化
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Gaussian小白求助 最近想優(yōu)化DPPF和Pd(OAc)2的螯合物，查了文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn)要用混合基組，但是這一部分沒有接觸過。查了一下小木蟲其他人做的寫出了以下輸入文件，不知道對(duì)不對(duì)。 因?yàn)榛旌蠙C(jī)組有人寫的是b3lyp/gen，還有人寫b3lyp/genecp或者b3lyp/gen pseudo=read，目前寫成第一種可以計(jì)算下去，但是還沒有算完。希望大神指點(diǎn)一下這些寫法有什么區(qū)別，同時(shí)看一下我這么寫輸入文件對(duì)不對(duì)。本來想放一下gauss view 畫的結(jié)構(gòu)，但是點(diǎn)擊上傳圖片沒有反應(yīng)，實(shí)在是對(duì)不住了。 %chk=D:/Cai/gaussian/Furan Artical/Pd-DPPF.chk %mem=1GB %nproc=1 # opt freq b3lyp/gen title 0 1 C C 1 B1 C 2 B2 1 A1 C 1 B3 2 A2 3 D1 C 4 B4 1 A3 2 D2 C 5 B5 4 A4 1 D3 C 6 B6 5 A5 4 D4 C 6 B7 5 A6 4 D5 C 7 B8 6 A7 5 D6 C 8 B9 6 A8 5 D7 Fe 9 B10 7 A9 6 D8 Pd 1 B11 2 A10 3 D9 O 12 B12 1 A11 2 D10 O 12 B13 1 A12 2 D11 C 13 B14 12 A13 1 D12 O 15 B15 13 A14 12 D13 C 14 B16 12 A15 1 D14 O 17 B17 14 A16 12 D15 C 15 B18 13 A17 12 D16 H 19 B19 15 A18 13 D17 H 19 B20 15 A19 13 D18 H 19 B21 15 A20 13 D19 C 19 B22 15 A21 13 D20 H 23 B23 19 A22 15 D21 H 19 B24 15 A23 13 D22 H 19 B25 15 A24 13 D23 B1 1.48193120 B2 1.38379624 B3 1.48146474 B4 1.38372071 B5 3.43192569 B6 1.38224965 B7 1.48650858 B8 1.47915197 B9 1.38292968 B10 2.15774562 B11 2.17519582 B12 1.94000000 B13 1.94000000 B14 1.43000000 B15 1.25840000 B16 1.43000000 B17 1.25840000 B18 1.54000000 B19 1.07000000 B20 1.07000000 B21 1.07000000 B22 3.33290692 B23 1.07000000 B24 2.60277666 B25 3.95106972 A1 117.95612818 A2 93.09498549 A3 118.27987077 A4 80.51882551 A5 80.22491113 A6 90.19610491 A7 117.99822155 A8 103.93841516 A9 59.23246337 A10 115.47097779 A11 113.87300177 A12 116.48312337 A13 109.47122063 A14 120.00000000 A15 109.47122063 A16 120.00000000 A17 120.00000000 A18 109.47122063 A19 109.47122063 A20 109.47122063 A21 70.52936823 A22 129.58891871 A23 82.21695687 A24 80.42015143 D1 16.44059389 D2 -16.50729926 D3 99.12701850 D4 0.70075937 D5 -103.45690189 D6 -99.49752318 D7 80.04534697 D8 67.52764485 D9 136.28990203 D10 -174.74631147 D11 65.49379626 D12 -130.18186358 D13 90.00000000 D14 89.56736649 D15 -30.00000000 D16 -90.00000000 D17 90.00000000 D18 -150.00000000 D19 -30.00000000 D20 131.37680951 D21 67.05203180 D22 141.49577983 D23 121.38559077 C 0 6-31g(d,p) **** H 0 6-31g(d,p) **** O 0 6-31g(d,p) **** Fe 0 6-31g(d,p) **** Pd 0 lanl2dz **** |
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paramecium86
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wkfg(金幣+2): 謝謝參與
wkfg: 金幣+10 2022-05-06 09:50:41
wkfg(金幣+2): 謝謝參與
wkfg: 金幣+10 2022-05-06 09:50:41
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混合基組寫法有誤。 1. 首先你的體系中含有重金屬。那么一定要帶有贗勢(shì)的，所以要么是genecp 要么是 gen pseudo=read 2. 贗勢(shì)基組包括兩部分 一個(gè)是基組部分 一個(gè)贗勢(shì)部分都要書寫 3. 基組部分 寫在前面 每一個(gè)基組后要用**** 即使是最后一個(gè)基組也要寫****, 不同基組之間不要空行。且使用相同基組的原子可以寫在一起。 4. 贗勢(shì)和基組部分之間要有空行 5. 贗勢(shì)部分不要寫**** 所以綜上所述你的輸入文件應(yīng)該寫成 %chk=d:/cai/gaussian/furan artical/pd-dppf.chk %mem=1gb %nproc=1 # opt freq b3lyp/genecp title 0 1 c c 1 b1 c 2 b2 1 a1 c 1 b3 2 a2 3 d1 c 4 b4 1 a3 2 d2 c 5 b5 4 a4 1 d3 c 6 b6 5 a5 4 d4 c 6 b7 5 a6 4 d5 下面坐標(biāo)我省略了 pd 0 lanl2dz **** c h o fe 0 6-31g(d,p) **** pd 0 lanl2dz |
wkfg4樓2022-05-05 22:23:54
6樓2022-05-06 09:49:46
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