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zzy329372570銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助,使用amber18的cpptraj從軌跡文件中提取rst文件缺少速度。
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我想使用cpptraj從動力學(xué)軌跡文件中提取某一幀作為下一個動力學(xué)窗口的起始rst文件。指令操作如下:cpptraj parm model.prmtop trajin xxx.cdf 2000 2000 1 trajout 2000.rst7 restart go 結(jié)果會生成一個2000.rst文件,但是我在使用這個文件進行下一步計算的時候,會報錯,ERROR: I could not find enough velocities in 13.5.rst7 此外,用這個指令生成的rst7文件大小與動力學(xué)自動保存的rst文件大小也不同。 想請問下這是什么原因?應(yīng)該怎么修改cpptraj指令呢?謝謝~! |
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